结论：处理违法建筑时，不应擅自采取停水停电措施，而应依法进行查处和拆除。以下是对此问题的详细法律分析：
一、法律依据
核心法律未明确授权：
- 《中华人民共和国城乡规划法》等核心法律并未明确授权相关行政执法部门可以采取断水断电的方式迫使当事人拆除违法建筑。这意味着，从法律层面讲，直接停水停电缺乏明确的法律依据。
特定法律条款的限制：
- 《中华人民共和国民法典》第九百四十四条明确规定，物业服务人不得采取停止供电、供水等方式催交物业费，这一原则精神同样适用于违法建筑的处理情形，即不得擅自停水停电。
- 《中华人民共和国电力法》第二十九条及第六十五条规定，只有供电企业才有权根据法律规定的程序和情形中断供电，物业作为非供电合同主体，无权对业主采取停电措施。
- 《城市供水条例》第二十二条也明确了停水的权利主体是供水企业，且需遵循严格程序，物业没有权力擅自对业主停水。
二、法定程序与要求
- 任何针对违法建筑的处理措施，包括可能的停水停电（如果法律有明确授权且程序合法），都必须严格遵循法定程序。这包括明确的法律依据、充分的调查取证、认定该建筑确实属于违法建筑，以及在实施任何措施前书面告知当事人相关的事实、理由和依据，并给予当事人陈述和申辩的机会。
三、停水停电的合法性与合理性分析
合法性存疑：
- 未经法定程序和行政机关要求，供水供电企业擅自对违法建筑停水停电，属于企业的不当行为，侵害了用户基于供水供电合同所享有的合法权益。
- 即使行政机关有权采取此类措施（在法律明确授权且程序合法的前提下），也必须确保程序的合法性和正当性，不能随意行使。
合理性不足：
- 断水断电等行为会严重影响当事人的基本生活，可能引发社会不稳定因素。
- 从人文关怀的角度出发，也不应轻易采取这种极端措施，而应寻求更加合理、和谐的解决方式。
四、正确处理方式
依法查处与拆除：
- 相关部门应依法对违法建筑进行查处，并按照法定程序进行拆除。这包括但不限于调查取证、认定违法事实、作出处罚决定以及执行拆除等步骤。
加强法律法规宣传与教育：
- 通过加强法律法规的宣传和教育，提高公众的法制意识和规划意识，从源头上减少违法建筑的产生。这有助于构建一个更加和谐、有序的城市环境。
寻求其他合法手段：
- 对于违法建筑的处理，可以寻求其他合法手段，如要求停止违规行为、恢复原状、赔偿损失等；向相关部门报告，由执法部门依法处理；或依据管理规约对业主进行处罚等。
建议：如果您面临违法建筑被停水停电的情况，或者您作为物业或相关部门需要处理违法建筑问题，请务必遵循法律程序，不要擅自采取停水停电等极端措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。