关于公司未按法院调解协议支付员工时，协议上违约金的具体数额，这并非是一个固定不变的数字，而是需要根据具体情况和双方协商来确定。以下是我从不同角度为你进行的分析：
违约金数额的确定原则：
- 违约金的主要目的是为了弥补因违约行为给对方造成的损失，并起到一定的惩罚作用。因此，在确定违约金数额时，通常会考虑违约方的违约程度、给对方造成的实际损失、双方的协商情况以及行业惯例等因素。
- 在劳动纠纷中，如果法院调解协议中明确规定了违约金的数额或计算方式，那么双方应当按照协议履行。如果协议中没有明确规定，或者规定不明确，那么双方可以协商确定一个合理的数额。
违约金数额的协商与确定：
- 在协商过程中，员工可以提出自己因公司违约所遭受的实际损失，如工资拖欠期间的利息损失、因寻找新工作而产生的费用等，作为确定违约金的参考。
- 公司则可以根据自身的经济状况和违约的严重程度，提出一个合理的违约金数额。双方可以在平等、自愿的基础上进行协商，以达成一个双方都能接受的数额。
法律对违约金数额的限制：
- 虽然违约金数额的确定具有一定的灵活性，但法律也对其进行了必要的限制。如果违约金数额过高或过低，都可能被法院或仲裁机构进行调整。
- 具体来说，如果违约金数额过高，超过了违约方因违约所造成的实际损失，那么违约方可以请求法院或仲裁机构予以减少；如果违约金数额过低，不足以弥补违约方给对方造成的损失，那么受损方可以请求法院或仲裁机构予以增加。
实际操作建议：
- 在签订法院调解协议时，双方应当尽可能明确违约金的数额或计算方式，以避免后续产生纠纷。
- 如果公司未按调解协议支付员工，员工可以先与公司进行协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。如果协商无果，员工可以向法院申请强制执行，或者提起新的诉讼要求公司支付违约金。
举例说明：假设员工与公司签订的法院调解协议中规定，如果公司未按约定时间支付员工工资，需要支付员工一个月工资作为违约金。如果公司确实违约了，那么员工就有权要求公司支付这一个月的工资作为违约金。当然，这只是一个简单的例子，实际情况可能更加复杂。
总结与建议：违约金数额的确定是一个复杂而灵活的过程，需要综合考虑多种因素。如果你遇到了公司未按法院调解协议支付员工的情况，建议你先与公司进行协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。如果协商无果，你可以向我咨询具体的法律程序和维权策略，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。