结论：公司因员工半天没来工作就认定旷工并扣除本月一半绩效的做法，不一定合法，具体是否合法需结合公司规章制度、劳动合同以及实际情况来判断。
从公司规章制度和劳动合同角度分析
规章制度合法性：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 如果公司规章制度中明确规定了旷工的定义、处罚措施，并且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，那么公司有权依据规章制度对旷工员工进行处罚。但处罚措施必须合理，不能违反法律法规的强制性规定。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了旷工的处罚措施，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司也有权依据劳动合同对旷工员工进行处罚。
从实际情况和合理性角度分析
半天未到岗是否构成旷工：
- 旷工通常指的是无正当理由未到岗工作。如果员工半天未到岗是因为合理原因（如突发疾病、家庭紧急情况等），并且及时向公司请假或说明情况，那么公司不应将其认定为旷工。
- 如果员工半天未到岗且无正当理由，那么公司可以依据规章制度或劳动合同认定其为旷工。
扣除一半绩效是否合理：
- 即使员工被认定为旷工，公司扣除其一半绩效的做法也需谨慎评估。绩效通常与员工的工作表现、工作成果等挂钩，而旷工只是员工未到岗的一种行为表现。公司应综合考虑旷工对工作的影响程度、员工的过往表现等因素，合理确定处罚措施。
- 如果扣除一半绩效明显过高，超出了合理范围，那么该处罚措施可能被视为违法或不合理。
建议
对于员工：
- 如果认为公司的处罚措施不合法或不合理，可以与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在处理此类纠纷时，应保留好相关证据（如请假记录、公司规章制度、劳动合同等），以便维护自己的合法权益。
对于公司：
- 应制定合法、合理的规章制度和劳动合同条款，明确旷工的定义和处罚措施。
- 在处理旷工事件时，应充分听取员工的解释和说明，确保处罚措施的合理性和公正性。
示例：假设某公司规章制度中规定“旷工一天扣除当月绩效的20%”，且该规章制度已经过民主程序制定并公示。如果员工半天未到岗且无正当理由被认定为旷工，那么公司扣除其当月绩效的10%（即半天对应的比例）可能更为合理；如果直接扣除一半绩效，则可能超出合理范围。
总之，公司因员工半天没来工作就认定旷工并扣除本月一半绩效的做法不一定合法，具体需结合公司规章制度、劳动合同以及实际情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。