结论：肇事车的保险赔付误工费与工伤保险的工伤假待遇并不冲突，二者可以同时获得，但需注意避免重复获赔同一项目。以下是具体分析：
法律性质不同，可并行主张
根据《工伤保险条例》第十四条，上下班途中受非本人主要责任的交通事故伤害属于工伤，可享受工伤保险待遇（包括停工留薪期工资）。而根据《民法典》侵权责任编，肇事方需赔偿因事故造成的实际损失（包括误工费）。二者属于不同法律关系，前者是社保保障，后者是侵权赔偿，因此可同时主张。
误工费与停工留薪期工资的差异
- 误工费：由肇事方保险公司赔付，计算依据为受害者实际减少的收入（需提供工资流水、纳税证明等），赔偿期限以医疗期或定残前一日为准。
- 停工留薪期工资：由工伤保险基金或用人单位支付，标准为工伤职工原工资福利待遇，期限以劳动能力鉴定结论为准（一般不超过12个月）。
关键点：若误工费实际金额低于停工留薪期工资，可要求补足差额；若高于，则以实际损失为限，但工伤保险不返还超额部分。
实务操作中的注意事项
- 避免重复获赔：需在诉讼或理赔中明确区分赔偿项目（如医疗费、护理费等不可重复主张），误工费与停工留薪期工资虽性质不同，但若存在重复计算（如按同一标准主张），可能被法院或保险公司要求扣除。
- 证据留存：需保存工资流水、病假证明、交通事故认定书等材料，以证明收入减少及工伤事实。
- 协商与诉讼策略：建议先通过工伤保险理赔停工留薪期工资，再向肇事方主张误工费差额；若协商无果，可同步提起工伤认定和侵权诉讼。
建议：若涉及复杂情况（如用人单位未缴纳社保、肇事方拒赔等），可进一步提供细节，我会结合具体案情分析赔偿路径及风险点。