结论：公司扣完绩效又扣病假工资是否合法，需根据具体情况判断，主要看公司规章制度是否合法、劳动合同是否有约定以及是否符合最低工资标准等。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
公司规章制度合法且劳动合同有约定：
- 如果公司的规章制度中明确规定了绩效工资和病假工资的扣除方式，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，同时劳动合同中也有相应的约定，那么公司按照规章制度扣除绩效工资和病假工资可能是合法的。
- 例子：假设公司规章制度规定，员工病假期间，绩效工资按一定比例扣除，且该比例不违反法律法规，同时劳动合同中也明确约定了这一点，那么公司按照此规定扣除是合法的。
公司规章制度不合法或劳动合同无约定：
- 如果公司的规章制度违反了法律法规的强制性规定，或者劳动合同中没有对绩效工资和病假工资的扣除进行约定，那么公司擅自扣除可能是不合法的。
- 例子：假设公司规章制度规定，员工病假期间，绩效工资全额扣除，且该规定违反了法律法规中关于病假工资支付的规定，那么公司按照此规定扣除就是不合法的。
二、病假工资的支付标准
- 根据相关法律法规，员工在病假期间，公司应当支付病假工资，且病假工资不得低于当地最低工资标准的80%（具体比例可能因地区而异）。
- 计算公式（以最低工资标准为X为例）：病假工资 ≥ X * 80%
- 如果公司扣除绩效工资后，员工的病假工资低于了这个标准，那么公司的扣除行为就是不合法的。
三、实际操作中的注意事项
审查公司规章制度：
- 员工在入职时，应仔细审查公司的规章制度，特别是关于工资支付、绩效扣除和病假工资的规定。
- 如果发现规章制度中有违法或不合理的内容，应及时向公司提出异议或寻求法律帮助。
保留相关证据：
- 员工应保留好与公司签订的劳动合同、工资条、考勤记录等相关证据，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
及时咨询与维权：
- 如果员工认为公司的扣除行为不合法，应及时向公司提出质疑，并要求公司给出合理的解释和依据。
- 如果公司不予理会或解释不合理，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：如果你对公司的扣除行为有疑问或认为不合法，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况和当地法律法规，为你提供专业的法律意见和维权建议。