当工程建设过程中出现超过合同金额的情况时，这是一个需要细致处理且涉及多方利益的问题。以下是我为您提供的详细处理流程和建议：
一、首要步骤：查阅并理解合同条款
审查变更与价格调整条款：
- 首先，应仔细查阅合同中关于工程变更、价格调整以及争议解决的具体约定。这些条款是处理超支问题的直接依据。
- 特别注意合同中是否有关于工程量增减、设计变更、物价波动等情况下价格调整的明确规定。
遵循计价规则：
- 如果合同中有明确的计价标准或方法，应严格按照这些规定来结算工程价款。这是处理超支问题的基本原则。
二、分析超支原因并确定责任方
工程变更与设计变更：
- 如果超支是由于工程量增加或设计变更导致的，且这些变更是基于合同约定的变更程序或双方协商一致，那么应按照变更后的约定来结算工程价款。
- 双方应明确新增部分的计价方式、费用标准，并可以参照签订合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或标准。
施工单位原因：
- 如果超支是由于施工单位自身原因，如施工浪费、管理不善、施工方案不合理等导致的，那么应由施工单位自行承担额外费用。发包方有权拒绝支付超出部分，并可以要求施工单位承担违约责任。
不可抗力等客观因素：
- 对于不可抗力等不可预见、不可避免的客观因素导致的超支，双方应根据公平合理原则协商分担费用。合同中通常会有不可抗力条款，明确了风险分担的方式。
三、积极沟通与协商解决
及时沟通：
- 一旦发现超支情况，施工方应尽快与发包方进行沟通，详细说明超支的原因、金额明细，并提出合理的解决方案。
- 发包方也应积极回应，共同探讨解决方案，避免问题进一步恶化。
签订补充协议：
- 如果双方通过协商达成一致，应签订补充协议，明确调整后的合同金额、支付方式、工期等关键内容。补充协议与原合同具有同等法律效力，是处理超支问题的重要依据。
四、若协商不成，考虑第三方介入或法律途径
第三方审计：
- 当双方对金额计算或增加原因有争议时，可以共同委托工程造价咨询机构进行审计。
- 审计机构将根据工程资料、现场实际情况进行客观、公正的审核，并出具审计报告作为确定工程金额的依据。
第三方调解：
- 在协商无果的情况下，可以寻求第三方调解机构介入，如行业协会、专业调解中心等。调解过程相对灵活高效，有助于双方达成和解。
仲裁或诉讼：
- 如果合同中有仲裁条款，一方可以根据约定向仲裁机构申请仲裁。仲裁程序简便，裁决结果具有终局性。
- 如果没有仲裁条款，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。诉讼过程中需准备充分证据，法院将依据法律法规和事实情况作出公正判决。
五、法律依据与总结建议
法律依据：
- 处理工程超出合同金额的问题时，应依据《中华人民共和国民法典》中关于合同编的相关规定，以及《建设工程价款结算暂行办法》等具体法规。
总结建议：
- 工程金额超出合同金额是一个复杂且敏感的问题，需要双方保持冷静、理性对待。
- 首先应依据合同条款进行初步判断和处理；其次通过友好协商寻求共识；必要时可借助第三方专业力量进行审计或调解；最后若仍无法解决争议，则应及时采取法律手段维护自身权益。
- 在整个过程中，双方应注重证据的收集和保存，以确保在处理争议时能够有据可依、有理可循。同时，保持沟通畅通，尊重合同约定和法律规定，以确保问题得到公平合理的解决。