事业病假6个月是否会扣工资，需根据具体情况及国家相关法律法规来确定，但一般来说，病假超过6个月后，工资会有所扣减。以下是对此问题的详细分析：
一、病假工资的基本规定
病假在两个月以内：
- 根据《国家机关工作人员病假期间生活待遇的规定》及相关政策，事业单位职工病假在两个月以内的，原工资照发，不扣基本工资。但单位可能根据内部规定扣发部分或全部的津贴、补贴和奖金。
病假超过两个月不足六个月：
- 从第三个月起，工作年限10年及以下的，发给本人基本工资的90%；工作年限11年及以上的，原工资照发（即100%）。同样，津贴、补贴和奖金可能根据出勤情况被扣发。
病假超过六个月：
- 从第七个月起，工资的计算方式主要依据工作年限来确定，并需遵循国家相关政策及地方规定。具体来说：
- 工作年限不满10年的：从第七个月起，可能发放本人工资的60%或70%，具体比例需参照当地最新政策或咨询相关部门以确定准确比例。
- 工作年限满10年及以上的：从第七个月起，可能发放本人工资的70%或80%，同样需参照当地最新政策或咨询以确认具体比例。
二、最低保障
- 根据《劳动法》规定，职工在法定医疗期内享受的病假工资或疾病救济费，不得低于当地最低工资标准的80%。这是病假工资支付的最低标准，无论工作年限如何，都应得到保障。
三、特殊情况
- 对于获得省部级以上劳动英雄、劳动模范称号，并且仍然保持荣誉的工作人员，其病假期间的工资，经过相关部门批准，可以适当提高。
- 某些事业单位可能因其性质、行业特点或与职工签订的具体合同协议，对病假工资的发放有特别约定。这些约定可能更为严格或优惠，需具体查看合同条款。
四、实际操作建议
- 了解当地政策：由于病假工资的计算标准可能因地区政策而有所不同，因此建议首先了解当地的人力资源和社会保障部门发布的最新政策。
- 查看合同条款：如果与单位签订了劳动合同或相关协议，应仔细查看其中关于病假工资的具体规定。
- 与单位沟通：如有疑问或需要进一步了解病假工资的计算方式，应与单位的人事部门或相关管理部门进行沟通。
- 保留医疗证明：在请病假时，应出示医院的疾病证明，以证明其确实因病需要请假。这是享受病假工资的前提条件。
举例说明：
假设某事业单位职工工作年限为8年，当地最低工资标准为2000元/月。如果该职工病假超过6个月，从第七个月起，其病假工资可能按照本人工资的60%或70%发放（具体比例需参照当地政策）。如果其本人工资为4000元/月，那么其病假工资可能为2400元/月或2800元/月。但无论如何，其病假工资都不得低于当地最低工资标准的80%，即1600元/月。
总结与建议：
事业病假6个月后，工资是否会扣减以及扣减的比例，需根据工作年限、当地政策以及单位规定来确定。建议职工在请病假前了解相关政策，与单位沟通清楚，并保留好医疗证明等材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。