在交通事故被认定为工伤的情况下，用人单位发放的停工留薪期工资和交通事故赔偿中的误工费，一般不能兼得，但具体能否同时获得需根据受伤性质、法律适用及赔偿主体等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律基础与性质区分
工伤赔偿中的停工留薪期工资：
- 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
- 性质：属于工伤保险待遇，旨在保障工伤职工在停工治疗期间的基本生活，由用人单位或社会保险机构支付。
交通事故赔偿中的误工费：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条，侵害他人造成人身损害的，应当赔偿因误工减少的收入。
- 性质：属于民事侵权赔偿范畴，旨在弥补受害者因侵权行为导致的收入损失，由侵权人支付。
二、不可兼得的法理基础
功能重叠性：
- 停工留薪期工资和误工费均旨在弥补劳动者因伤导致的收入损失。若允许双重获赔，将导致重复补偿，违背公平原则。
法律适用优先性：
- 在工伤情形下，应优先适用《工伤保险条例》，享受工伤保险待遇，包括停工留薪期工资。此时，受害者不得再向侵权人主张误工费。
- 若涉及第三方侵权（如交通事故），受害者虽可通过民事诉讼获得误工费赔偿，但该赔偿已涵盖全部损失，不得再行主张工伤待遇中的同类补偿。
三、特殊情形的处理规则
第三方侵权与工伤竞合：
- 典型案例：上下班途中遭遇交通事故被认定为工伤时，医疗费等直接损失不可重复索赔。但部分省份允许受害者就差额部分主张补充赔偿，即若交通事故赔偿中的误工费低于工伤停工留薪期工资，受害者可就差额部分向用人单位主张。
- 处理原则：遵循“填平原则”，避免过度补偿。受害者获得的赔偿总额不得超过其实际损失。
非全日制用工或未参保情形：
- 若用人单位未依法参加工伤保险，职工发生工伤时，虽由用人单位支付停工留薪期工资，但该待遇本质仍属工伤保障体系范畴，与民事误工费存在替代关系，不得兼得。
四、实务操作建议
证据收集：
- 主张误工费时，需提供收入证明、银行流水、纳税记录等材料，以证明实际减少的收入。
- 申请停工留薪期工资时，需提交工伤认定决定书、医疗诊断证明等文件，以证明工伤事实及停工留薪期期限。
程序选择：
- 优先选择工伤认定程序，享受法定工伤保险待遇。
- 若涉及第三方责任，需在工伤赔偿与侵权诉讼间进行损益相抵计算，确保赔偿总额不超过实际损失。
五、举例说明
假设某职工在上下班途中遭遇交通事故，被认定为工伤。其月工资为5000元，停工留薪期为3个月。同时，交通事故责任方赔偿其误工费1万元（按实际误工时间计算，但低于工伤停工留薪期工资总额）。在此情况下：
- 若按不可兼得原则：该职工可选择享受工伤停工留薪期工资1.5万元（5000元/月×3月），或接受交通事故赔偿中的误工费1万元。若选择工伤待遇，则不得再主张交通事故中的误工费；反之亦然。
- 若按补充赔偿原则（部分省份适用）：该职工可先接受交通事故赔偿中的误工费1万元，然后就差额部分5000元向用人单位主张工伤停工留薪期工资补充赔偿。
综上所述，交通事故被认定为工伤时，停工留薪期工资和误工费一般不能兼得。但具体处理需根据当地法律法规、政策规定及实际情况来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。