若未成年人犯罪被判五年有期徒刑，法院未封存其犯罪档案，这一做法通常是不合法的，但具体还需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、法律依据与封存条件
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条的规定，对于犯罪时不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的未成年人，其犯罪记录应当予以封存。这是法律对未成年人特殊保护的重要体现，旨在减少其未来生活和就业中的歧视与障碍。因此，若未成年人符合上述条件，法院未封存其犯罪档案，则违反了法律规定。
二、未封存的可能原因及应对措施
工作疏漏或信息录入错误：
- 法院可能因工作疏漏或信息录入错误而未封存犯罪档案。
- 应对措施：向原办案的公安机关、人民检察院、人民法院了解未封存的原因，并提交书面或口头申请，要求按照法律规定进行档案封存。同时，准备身份证、出生证明等能证明犯罪时系未成年人身份的材料，以及判决书等相关证明材料。
不符合封存条件：
- 若未成年人被判处的刑罚超过五年有期徒刑，则不符合封存条件。
- 应对措施：在此情况下，法院未封存犯罪档案是合法的。但若认为判决存在错误或量刑过重，可依法提出上诉或申诉。
其他特殊情况：
- 存在某些特殊情况，如未成年人犯罪涉及严重暴力、恐怖活动等，可能不被纳入封存范围。
- 应对措施：若认为特殊情况不成立或法院对特殊情况的认定存在错误，可依法提出异议并要求重新审查。
三、申请封存的具体步骤与途径
与原办案机关沟通：
- 向原办案的公安机关、人民检察院、人民法院了解未封存的原因，并提交书面申请要求封存。
联系司法行政部门：
- 若涉及刑罚执行，需与司法行政部门（如监狱管理机关）沟通，请求协助处理档案封存事宜。
申请复议或提出申诉：
- 若办案机关拒绝封存或未在合理期限内处理申请，可向上一级公安机关、人民检察院等机关申请复议，或向同级人民检察院提出申诉。
向有关部门反映情况：
- 若通过上述途径仍无法解决问题，可向当地人大常委会或政府信访部门反映情况，以促使问题得到解决。在合法合规的前提下，也可通过媒体渠道反映问题，但需注意保护未成年人的隐私和合法权益。
四、法律后果与维权建议
- 法律后果：若法院未依法封存符合条件的未成年人犯罪档案，可能面临内部监督机制的纠正或上级机关的责令整改。同时，未成年人及其监护人也有权依法维权。
- 维权建议：在整个过程中，务必保持冷静和理性，遵循法律程序，尊重相关机关的决定，并积极配合提供必要的材料和证据。同时，关注未成年人的心理健康和成长需求，给予他们必要的关爱和支持。
综上所述，若未成年人犯罪被判五年有期徒刑且符合封存条件，法院未封存其犯罪档案则违反了法律规定。在此情况下，应通过与原办案机关沟通、联系司法行政部门、申请复议或提出申诉等途径维护合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。