工厂在特殊工种退休原始材料不齐的情况下，确实可能承担一定的责任，但具体责任需根据材料缺失的原因、工厂的过错程度以及相关法律法规的规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、工厂的责任基础

1. 档案管理义务：工厂作为员工工作记录的保管者，有义务妥善保存员工的档案材料，包括特殊工种的工作记录、工资单、考勤表等。这些材料是员工申请特殊工种退休的重要依据。如果工厂未能履行这一义务，导致材料缺失，那么工厂可能因未尽到档案管理责任而承担相应的法律责任。

2. 协助义务：在员工申请特殊工种退休的过程中，工厂有义务提供必要的协助，如出具工作证明、提供相关材料等。如果工厂拒绝提供协助或故意隐瞒、销毁材料，导致员工无法顺利申请退休，工厂也可能因此承担责任。

二、责任的具体判断

1. 材料缺失的原因：

   • 如果材料缺失是由于工厂的疏忽或管理不善导致的，如档案丢失、损坏等，那么工厂应承担主要责任。
   • 如果材料缺失是由于员工个人原因或不可抗力因素导致的，如员工自行销毁材料、自然灾害等，那么工厂的责任可能相对较轻或无需承担责任。

2. 工厂的过错程度：

   • 工厂的过错程度也是判断其责任大小的重要因素。如果工厂存在故意隐瞒、销毁材料或拒绝提供协助等恶意行为，那么其责任将更为严重。
   • 如果工厂只是因疏忽或管理不善导致材料缺失，且能够积极采取措施进行补救，如协助员工重新收集材料、出具证明等，那么其责任可能相对较轻。

3. 相关法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国社会保险法》以及相关地方性法规和政策，工厂在员工退休过程中应承担一定的义务和责任。具体责任可能因地区和政策而异，但通常都包括提供必要的材料和协助。

三、法律建议

1. 与工厂协商：如果员工发现特殊工种退休原始材料不齐，首先应与工厂进行协商，要求工厂提供必要的协助和补救措施。

2. 向相关部门投诉：如果工厂拒绝提供协助或无法补救材料缺失的问题，员工可以向当地劳动保障部门或社保机构投诉，寻求帮助和支持。

3. 寻求法律援助：在必要时，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可能的法律途径，以维护自己的合法权益。

特殊工种退休原始材料不齐时，工厂的责任需根据具体情况来判断。如果员工遇到此类问题，建议及时与工厂协商并寻求相关部门的帮助和支持。如有需要，也可以直接向我咨询相关法律问题。