在公安机关已经立案调查的情况下，仍然可以起诉或申请仲裁，但具体情形需根据案件性质和法律规定来判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 刑事案件与民事起诉的关系

   • 刑事立案不影响民事起诉：如果公安机关立案的是刑事案件，而你希望就同一事实或相关事实提起民事诉讼（如因犯罪行为导致的财产损失、人身伤害赔偿等），这是完全可行的。刑事案件和民事案件是两个独立的法律程序，刑事立案并不妨碍你通过民事诉讼来维护自己的合法权益。
   • 刑事附带民事诉讼：在刑事案件审理过程中，如果被害人因犯罪行为遭受了物质损失，还可以在刑事诉讼中提起附带民事诉讼，要求犯罪嫌疑人或被告人赔偿损失。这种方式可以节省诉讼时间和成本，提高诉讼效率。

2. 刑事案件与仲裁的关系

   • 仲裁协议的有效性：如果双方在纠纷发生前或发生后达成了仲裁协议，并且该协议符合法律规定（如双方自愿、仲裁事项属于仲裁范围等），那么即使公安机关已经立案调查，你仍然可以根据仲裁协议向约定的仲裁机构申请仲裁。
   • 仲裁与刑事立案的独立性：仲裁是一种非诉讼的纠纷解决方式，其程序与刑事立案程序相互独立。仲裁机构在受理仲裁申请后，会按照仲裁规则进行审理，并作出裁决。刑事立案不会影响仲裁程序的进行，但仲裁裁决的执行可能会受到刑事案件处理结果的影响（如如果犯罪嫌疑人或被告人被判处刑罚，其财产可能被查封、冻结或没收，从而影响仲裁裁决的执行）。

3. 特殊情况下的限制

   • 涉及国家秘密或个人隐私的案件：如果案件涉及国家秘密或个人隐私，可能会受到一定的限制。例如，在刑事案件中，如果案件涉及国家秘密，可能会限制某些诉讼参与人的参与或公开审理；在民事诉讼中，如果案件涉及个人隐私，可能会要求不公开审理。但这些限制并不影响你提起诉讼或申请仲裁的权利，只是可能在程序上有所特殊。
   • 仲裁协议无效或失效的情况：如果仲裁协议存在无效或失效的情形（如仲裁协议约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议等），那么仲裁机构将不会受理仲裁申请。此时，你只能通过诉讼或其他方式来解决纠纷。

法律建议：

• 在决定起诉或申请仲裁前，建议你先咨询专业律师，了解案件的具体性质和法律规定，以便做出更明智的选择。
• 如果案件涉及复杂的法律问题或多个法律程序，建议你寻求专业律师的协助，以确保你的权益得到充分维护。

可能后果：

• 如果你选择起诉或申请仲裁，并成功获得了法院的判决或仲裁机构的裁决，那么你将有权要求对方履行判决或裁决所确定的义务。
• 如果对方不履行判决或裁决，你可以向法院申请强制执行，以维护自己的合法权益。

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