结论：针对法定代表人也是股东将其用于公司来往的私人帐户资金占为己有的情况，公司应首先通过内部治理机制进行纠正，若无法解决，则可考虑通过法律途径追究其责任。具体应对策略需根据资金性质、占有人行为性质及公司章程等具体情况来制定。

分析：

1. 内部治理机制：

   • 股东会或董事会决议：公司应首先尝试通过股东会或董事会的决议来纠正该行为。如果法定代表人（也是股东）的行为违反了公司章程或股东会、董事会的决议，其他股东或董事可以提议召开会议，通过决议要求其返还资金或采取其他纠正措施。
   • 公司章程规定：检查公司章程中是否有关于股东或法定代表人不得擅自将公司资金转入个人账户或占为己有的规定。如果有，可以依据公司章程的规定，要求其承担相应的责任。

2. 法律途径：

   • 民事诉讼：如果内部治理机制无法解决问题，公司可以考虑向法院提起民事诉讼，要求法定代表人（股东）返还被占用的资金，并可能要求其赔偿因此给公司造成的损失。在诉讼过程中，公司需要提供充分的证据证明资金被占用的事实以及占用人与公司的关系。
   • 刑事责任：如果法定代表人的行为涉嫌犯罪，如挪用资金罪或职务侵占罪等，公司可以向公安机关报案，要求追究其刑事责任。在报案时，公司需要提供初步的证据材料，以支持其指控。

3. 资金性质与行为性质：

   • 资金性质：需要明确被占用的资金是否属于公司资产。如果资金确实属于公司，那么法定代表人的行为就构成了对公司财产的侵占。
   • 行为性质：分析法定代表人的行为是否构成违法或犯罪。这需要根据具体行为、资金数额、持续时间以及是否对公司造成损害等因素来综合判断。

4. 公司章程与股东协议：

   • 公司章程：公司章程是公司治理的基本文件，其中可能包含对股东或法定代表人行为的限制和约束。在应对此类问题时，应仔细审查公司章程的相关规定。
   • 股东协议：如果股东之间有签订股东协议，且协议中包含了关于资金使用和管理的条款，那么这些条款也可以作为追究法定代表人责任的依据。

建议：

• 加强内部管理：公司应建立健全的财务管理制度，明确资金的使用和管理流程，防止类似事件再次发生。
• 及时咨询专业律师：在处理此类问题时，公司应及时咨询专业律师，以获取专业的法律意见和帮助。律师可以根据具体情况，为公司提供针对性的法律建议和解决方案。
• 保留证据：公司应妥善保留与资金占用相关的所有证据，包括银行转账记录、会计凭证、合同协议等，以便在需要时提供给法院或公安机关。

后续行动：

• 如果公司决定采取法律途径解决问题，应尽快收集证据并准备相关材料，以便及时向法院提起诉讼或向公安机关报案。
• 在处理过程中，公司应保持与股东、董事和员工的沟通，确保信息的透明和准确，以维护公司的稳定和声誉。

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