招标过程中代理公司收了好处费五万元，这一行为是严重的，可能涉及违法甚至犯罪。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律定性
行政违法：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标代理机构在招标过程中应当遵循公平、公正、公开的原则，不得收受贿赂或好处费。收受好处费的行为违反了招标投标法的规定，可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得、暂停或取消招标代理资格等。
刑事犯罪：
- 如果收受的好处费数额较大，或者存在多次收受、为特定投标人谋取利益等情节，可能构成《中华人民共和国刑法》中的非国家工作人员受贿罪或受贿罪（如果涉及国家工作人员）。根据刑法规定，非国家工作人员受贿罪数额较大的，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，可处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产。
二、具体情节与后果
数额大小：
- 五万元的好处费，在司法实践中通常会被视为数额较大，足以构成非国家工作人员受贿罪的起罚标准。当然，具体是否构成犯罪还需结合其他情节综合判断。
情节严重性：
- 除了数额大小外，收受好处费的情节严重性也是判断是否构成犯罪的重要因素。例如，如果代理公司多次收受好处费、为特定投标人谋取不正当利益、导致招标结果不公正等，都会加重情节的严重性。
法律后果：
- 一旦构成犯罪，代理公司及其相关责任人员将面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金或没收财产等。同时，代理公司的声誉和信誉也会受到严重损害，可能影响其未来的业务发展和市场竞争力。
三、建议与措施
立即停止违法行为：
- 如果代理公司已经收受了好处费，应立即停止该行为，并主动向相关部门报告情况，争取从轻或减轻处罚。
配合调查与整改：
- 代理公司应积极配合相关部门的调查工作，如实说明情况，提供相关证据。同时，应制定整改措施，加强内部管理，防止类似行为再次发生。
寻求法律帮助：
- 代理公司可以咨询专业律师，了解相关法律规定和处罚标准，制定合理的应对策略。律师可以帮助代理公司分析案情、提供法律意见，并在必要时代表代理公司参与诉讼或调解。
总结来说，招标过程中代理公司收受好处费五万元是严重的违法行为，可能涉及行政处罚和刑事犯罪。代理公司应立即停止该行为，配合调查与整改，并寻求法律帮助以降低风险。如果你或你的公司遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。