在交通事故中，单方委托鉴定机构进行鉴定，法院是否会承认，这主要取决于鉴定机构的资质、鉴定程序的合法性以及鉴定结论的合理性等多个因素。以下是对这一问题的详细分析：
鉴定机构资质：
- 首先，单方委托的鉴定机构必须具备相应的资质和认证。根据《司法鉴定程序通则》等相关规定，只有具备合法资质的鉴定机构出具的鉴定报告才具有法律效力。如果鉴定机构不具备相应资质，或者其鉴定范围超出了其资质范围，那么其出具的鉴定报告很可能不会被法院采纳。
鉴定程序合法性：
- 其次，鉴定程序必须合法合规。这包括鉴定机构的选定、鉴定过程的记录、鉴定人员的资质和鉴定结论的出具等各个环节。如果鉴定程序存在瑕疵或违法，比如鉴定人员不具备相应资质、鉴定过程未记录或记录不完整等，那么鉴定结论的合法性就会受到质疑，法院可能不会承认。
鉴定结论合理性：
- 最后，鉴定结论必须合理且符合实际情况。法院在审查鉴定结论时，会考虑其是否与案件事实相符、是否科学合理等因素。如果鉴定结论存在明显不合理或与案件事实不符的情况，法院有权不予采纳。
特殊情况说明：
- 在某些情况下，即使单方委托的鉴定机构具备资质且鉴定程序合法，但如果对方对鉴定结论提出异议，并申请重新鉴定，法院也可能会根据案件情况决定是否准许重新鉴定。重新鉴定可能会由双方共同委托的鉴定机构进行，或者由法院指定的鉴定机构进行。
法律建议：
- 为了确保鉴定结论的合法性和有效性，建议在发生交通事故后，尽量通过双方协商或法院指定的方式选择鉴定机构进行鉴定。这样可以减少后续争议和纠纷的可能性。
- 如果确实需要单方委托鉴定机构进行鉴定，务必确保鉴定机构具备相应资质、鉴定程序合法合规，并保留好相关证据和记录，以备不时之需。
可能后果：
- 如果单方委托的鉴定机构出具的鉴定报告不被法院采纳，可能会导致案件事实无法查清或认定错误，进而影响案件的判决结果。因此，在选择鉴定机构和进行鉴定时务必谨慎行事。
综上所述，单方委托鉴定机构进行鉴定在交通事故中并非绝对不可行，但需要确保鉴定机构具备资质、鉴定程序合法合规以及鉴定结论合理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。