结论：厂内禁烟安全人员未经允许进入办公室搜查的行为，可能涉及侵犯个人隐私权及违反法定程序的问题，具体需根据实际情况判断其合法性。以下从多个角度进行分析：
一、法律角度
隐私权保护：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。办公室作为员工的工作场所，同样属于个人隐私的范畴，未经允许擅自搜查可能构成对隐私权的侵犯。
法定程序：
- 搜查行为通常需要遵循严格的法定程序，如由有权机关（如公安机关）依法进行，并出示相应的搜查令或相关法律文件。厂内禁烟安全人员作为企业内部的安全管理人员，并不具备法律赋予的搜查权，因此其未经允许进入办公室搜查的行为可能违反法定程序。
二、实际操作角度
企业规章制度：
- 企业可以制定内部规章制度来规范员工的行为，包括禁烟规定。然而，这些规章制度必须合法、合理，且不得侵犯员工的合法权益。如果企业规章制度中规定了搜查权，但该规定本身违反了法律法规或侵犯了员工的隐私权，那么该规定将是无效的。
搜查的合理性：
- 即使企业认为有必要进行搜查，也应确保搜查的合理性。这包括搜查的目的必须正当、搜查的方式必须合法且必要、搜查的范围应限于与搜查目的相关的区域等。未经允许擅自扩大搜查范围或采用不合理的搜查方式，都可能构成对员工权益的侵犯。
三、建议与措施
与安全人员沟通：
- 首先，可以尝试与厂内禁烟安全人员进行沟通，了解其搜查的原因和目的，并表达对其未经允许搜查的不满和担忧。通过沟通，可能能够解决问题并避免进一步的冲突。
向企业高层反映：
- 如果沟通无果，可以向企业的高层管理人员反映情况，要求其介入处理。企业高层应重视员工的合法权益，对安全人员的行为进行调查并采取相应的措施。
寻求法律援助：
- 如果认为自己的隐私权受到了严重侵犯，且企业未能给予合理的解决，可以考虑寻求法律援助。可以咨询专业律师，了解自己的权益和可行的法律途径，如提起民事诉讼等。
后续思考：在处理此类问题时，应充分考虑法律的规定和企业的实际情况，既要维护员工的合法权益，也要确保企业的正常运营和管理秩序。如果遇到类似情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。