结论：主合同约定仲裁，保证合同是否适用仲裁，需根据保证合同的具体约定以及相关法律规定来判断。以下从不同角度进行分析：
保证合同有仲裁条款的情况：
- 如果保证合同中明确约定了仲裁条款，且该仲裁条款符合《中华人民共和国仲裁法》的相关规定（如存在有效的仲裁协议、仲裁事项属于可仲裁范围等），那么主合同和保证合同之间的纠纷，包括因保证合同产生的纠纷，均应通过仲裁方式解决。
- 法律依据：根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条：“仲裁协议包括合同中订立的仲裁条款和以其他书面方式在纠纷发生前或者纠纷发生后达成的请求仲裁的协议。仲裁协议应当具有下列内容：（一）请求仲裁的意思表示；（二）仲裁事项；（三）选定的仲裁委员会。”
保证合同无仲裁条款，但主合同有仲裁条款的情况：
- 在这种情况下，保证合同本身并未约定仲裁作为争议解决方式。如果保证人同意受主合同仲裁条款的约束，或者保证合同中明确提及主合同的仲裁条款并表示接受，那么因保证合同产生的纠纷也可能通过仲裁解决。但这需要保证人的明确同意或保证合同中的特别约定。
- 如果保证合同中没有仲裁条款，且保证人未同意受主合同仲裁条款的约束，那么因保证合同产生的纠纷通常应通过诉讼方式解决，除非双方后续达成仲裁协议。
- 法律背景：仲裁协议具有相对性，一般仅对签署协议的双方具有约束力。除非有特别约定或法律规定，否则仲裁协议不会自动扩展至未签署该协议的第三方，如保证人。
特殊情况下的考虑：
- 如果主合同和保证合同构成一个整体交易，且保证合同的存在是为了保障主合同的履行，那么在某些情况下，法院或仲裁机构可能会认为保证合同应受主合同仲裁条款的约束，尤其是当保证合同中未明确排除仲裁作为争议解决方式时。但这并非绝对，需根据具体案情和法律规定来判断。
- 实践建议：为避免争议，建议在签署保证合同时，明确约定争议解决方式，包括是否适用主合同的仲裁条款。如果希望保证合同独立于主合同进行争议解决，也应在保证合同中明确说明。
法律建议：
- 在签署任何合同（包括主合同和保证合同）时，务必仔细阅读并理解合同中的争议解决条款，包括仲裁条款。
- 如果对合同中的仲裁条款有疑问或不确定其法律效力，建议咨询专业律师以获取法律意见。
- 在涉及复杂交易或多方参与的情况下，考虑在合同中明确约定争议解决方式的适用范围和效力，以减少未来可能出现的法律纠纷。
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