若调解完毕后被告发现新证据，可分以下两种情况处理：

1. 调解协议已生效且履行完毕
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，调解书经双方签收后即具有法律效力，与判决书具有同等强制执行力。若调解协议已履行完毕（如被告已支付赔偿款、履行义务等），原则上不得以新证据为由推翻原调解结果。法律对调解结果的稳定性有较高保护，除非存在重大程序违法（如调解违反自愿原则、内容违法等），否则新证据不影响已生效调解的效力。

2. 调解协议未履行或存在特殊情形

   • 若调解协议尚未履行：被告可尝试与原告协商，以新证据为由请求变更调解内容（如减少赔偿金额、调整履行方式等）。若协商不成，被告可向法院申请撤销调解协议，但需满足《民事诉讼法》第2零八条规定的条件（如调解违反自愿原则、内容违法等）。新证据本身并非直接撤销调解的法定理由，但若新证据能证明调解时存在重大误解、欺诈或显失公平，可能成为申请撤销的辅助依据。
     
   • 若调解协议存在无效情形：如调解内容违反法律强制性规定（如调解结果涉及非法利益），或调解程序严重违法（如未依法送达、未告知权利义务等），被告可向法院申请宣告调解无效，此时新证据可作为证明无效的直接证据。

实务建议：

• 被告应尽快固定新证据（如收集、公证、鉴定等），并评估其对调解结果的影响程度。
  
• 若调解协议尚未履行，建议优先与原告协商解决，避免诉讼成本；若协商无果，再考虑申请撤销或宣告无效。
  
• 若调解协议已履行，除非存在极端特殊情形（如调解时被胁迫、新证据能彻底推翻原事实认定），否则推翻调解的可能性极低，此时被告需承担调解结果的法律后果。
  

温馨提示：调解是快速解决纠纷的方式，但需谨慎评估风险。若对调解结果有疑虑，建议在签署前咨询专业律师，避免后续争议。如有具体案件细节，可进一步向我说明，我会为您详细分析。