法院判决的强拆赔偿款与补偿款在性质和目的上存在差异，因此不能直接按补偿款收取，但具体处理需结合判决内容和实际情况。以下从几个方面进行详细分析：
一、赔偿款与补偿款的性质差异
赔偿款：通常是由于行政机关或相关责任方的违法行为（如非法强拆）给当事人造成损失，法院根据损失情况判决责任方支付的款项。赔偿款具有惩罚性和补偿性双重性质，旨在弥补当事人的实际损失，并对违法行为进行一定的制裁。
补偿款：则是在合法拆迁过程中，拆迁方根据相关法律法规和政策，对被拆迁方因拆迁而遭受的损失给予的合理补偿。补偿款主要具有补偿性质，旨在保障被拆迁方的基本生活水平和合法权益。
二、法院判决的强拆赔偿款的处理
执行判决：如果法院已经就强拆赔偿款作出了判决，那么双方应当按照判决内容执行。赔偿款的金额、支付方式等都会在判决中明确规定，双方需严格遵守。
与补偿款的关系：虽然赔偿款和补偿款都是对当事人损失的弥补，但它们的来源、性质和目的不同。因此，法院判决的强拆赔偿款不能直接按补偿款收取。如果拆迁方已经支付了补偿款，但法院又判决了赔偿款，那么拆迁方需要额外支付赔偿款，以履行法院判决。
三、实际操作中的注意事项
核对判决内容：在处理强拆赔偿款时，首先要仔细核对法院的判决内容，确保对赔偿款的金额、支付方式等有清晰的认识。
与拆迁方协商：如果拆迁方对判决有异议或无法立即支付赔偿款，可以与拆迁方进行协商，寻求合理的解决方案。例如，可以协商分期支付赔偿款或提供其他形式的担保。
申请强制执行：如果拆迁方拒绝履行法院判决，当事人可以向法院申请强制执行。法院会依法采取强制措施，确保判决得到执行。
四、特殊情况下的处理
在某些特殊情况下，如拆迁方已经支付了补偿款，但法院认为补偿标准过低或存在其他违法行为，可能会判决拆迁方额外支付赔偿款。这种情况下，赔偿款和补偿款是并存的，拆迁方需要同时支付两笔款项。
总结与建议：
法院判决的强拆赔偿款与补偿款在性质上存在差异，不能直接按补偿款收取。在处理强拆赔偿款时，应仔细核对法院判决内容，与拆迁方进行协商，并在必要时申请强制执行。如果遇到特殊情况或复杂问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。