政府棚改拆迁协议盖村委会章而不盖集体经济组织章，可能涉及以下几个方面的原因和法律考量：

1. 村委会与集体经济组织的职能差异：

   • 村委会（村民委员会）是村民自我管理、自我教育、自我服务的基层群众性自治组织，负责办理本村的公共事务和公益事业，调解民间纠纷，协助维护社会治安，向人民政府反映村民的意见、要求和提出建议等。在拆迁过程中，村委会可能作为村民与政府之间的沟通桥梁，负责传达政策、组织村民协商等事宜。
   • 集体经济组织则主要负责管理集体资产、开发集体资源、发展集体经济和服务集体成员等经济职能。虽然集体经济组织在拆迁中也可能涉及土地和房屋等资产的管理，但其主要职责并不直接涉及拆迁协议的签订。

2. 拆迁协议的签订主体：

   • 拆迁协议通常是由拆迁人（如政府或其指定的部门）与被拆迁人（如村民或房屋所有权人）签订的。在这个过程中，村委会可能作为被拆迁人的代表或协助方参与协议的签订，但并非协议的直接主体。
   • 如果拆迁涉及的是集体土地上的房屋，且这些房屋属于集体经济组织所有或由集体经济组织管理，理论上集体经济组织也可能成为拆迁协议的一方。但在实际操作中，由于村委会与村民之间的紧密联系和沟通便利性，村委会往往更直接地参与到拆迁协议的签订过程中。

3. 实际操作中的便利性和效率：

   • 村委会作为基层自治组织，与村民之间的联系更为紧密，能够更直接地了解村民的需求和意见，因此在拆迁协议的签订过程中能够更有效地传达政策、组织协商和解决问题。
   • 相比之下，集体经济组织可能更专注于经济事务的管理和发展，对于拆迁协议的签订等具体事务可能缺乏足够的经验和资源。因此，在实际操作中，政府可能更倾向于与村委会合作签订拆迁协议，以提高效率和减少沟通成本。

4. 法律合规性考量：

   • 虽然村委会和集体经济组织在职能上有所差异，但只要拆迁协议的签订符合相关法律法规的规定，且得到了被拆迁人的认可和同意，那么盖村委会章而不盖集体经济组织章并不一定构成法律问题。
   • 然而，如果拆迁协议涉及的是集体经济组织所有的资产或土地，且未经集体经济组织同意或授权，那么仅盖村委会章可能存在法律风险。在这种情况下，建议政府或拆迁部门在签订协议前与集体经济组织进行充分沟通和协商，确保协议的合法性和有效性。

针对您的情况，我给出以下建议：

• 如果您对拆迁协议的签订主体或盖章情况有疑问，建议首先查阅相关的拆迁政策和法律法规，了解拆迁协议的签订要求和程序。
• 如果您认为拆迁协议的签订存在不合规或侵犯您权益的情况，建议及时与政府或拆迁部门进行沟通协商，寻求解决方案。
• 如果沟通协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，了解您的法律权益和可行的维权途径。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。