针对您提出的“国有企业施工合同先施工后签合同怎么处理”的问题，这是一个涉及法律风险和合同管理的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、法律风险认知

首先，需要明确的是，“先施工后签合同”的做法存在较大的法律风险。这种做法可能违反了相关法律法规对于合同签订和工程管理的规定，一旦发生纠纷，可能给双方带来不必要的法律麻烦和经济损失。

二、应对措施与建议

1. 尽快补签合同：

   • 双方应立即着手协商并签订书面合同，明确工程范围、质量标准、价款支付、工期等关键条款。
   • 合同中应设置追溯性条款，确认合同对施工开始日至合同签订日期间双方实际履行行为具有追溯效力，以减少后续纠纷。

2. 全面收集证据：

   • 施工方应全面收集和保存施工图纸、工程联系单、施工日志、现场照片、视频等施工过程资料。
   • 双方应妥善保存往来函件、电子邮件、短信、微信聊天记录等沟通记录，以证明双方的真实意思表示和责任划分。

3. 已施工部分验收与质量确认：

   • 双方应对已经完成的施工部分进行验收，并确认其质量和价值。
   • 如发现质量问题或不符合约定的情况，应及时采取补救措施并记录在案，作为后续纠纷处理的依据。

4. 遵守法定要求与防范纠纷风险：

   • 双方应严格遵守相关法律法规和建筑规范，确保工程质量和施工安全。
   • 如出现纠纷，应首先尝试友好协商解决；协商不成的，可根据合同约定或法定程序选择申请调解、仲裁或提起诉讼。

5. 工程款支付管理：

   • 确保工程款的支付与合同约定相符，并保留好相关支付凭证。
   • 如出现支付争议，这些凭证将作为解决争议的重要依据。

三、特殊情况说明

需要注意的是，如果您的项目原本应通过招标程序确定施工单位，但实际却先施工后招标（尽管您未直接提及此情况，但为全面解答，我需提及），那么这种行为将严重违反《中华人民共和国招标投标法》及相关法律法规。此时，应立即停止施工，并按照法定程序重新招标，同时接受相关部门的处罚和纠正。

四、总结与建议

综上所述，“先施工后签合同”的做法存在较大的法律风险，应尽量避免。若已出现此情况，需采取积极措施补救，包括尽快补签合法有效的书面合同、全面收集证据、遵守法定要求及积极防范纠纷风险等。同时，建议双方在未来的合作中加强合同管理和法律意识，确保所有工程活动都在合法合规的框架内进行。如有需要，可寻求专业法律人士的帮助和指导。