公司被对方冒用虚开发票属于严重的违法行为，您需要立即采取以下措施来维护公司权益并降低法律风险：

1. 立即内部自查并固定证据

   • 第一时间梳理公司财务记录、合同、物流单据等，确认被冒用的具体发票信息（如开票时间、金额、内容等），并留存所有相关凭证。
     
   • 若发现公司公章、合同章或财务章被伪造或盗用，需立即报警并取得《受案回执》，这是后续维权的关键证据。
     
   • 注意：自查过程中需严格保密，避免内部人员销毁或篡改证据。

2. 向税务机关举报并配合调查

   • 携带自查证据（如发票复印件、合同、付款记录等）向公司所在地主管税务机关提交《税务违法案件举报书》，说明被冒用虚开发票的事实。
     
   • 税务机关立案后，需积极配合调查，如实提供材料并说明情况。若公司确属被冒用，税务机关会出具《税务事项通知书》或类似文件，明确公司无主观故意。
     
   • 风险提示：若公司未及时举报或配合调查，可能被税务机关认定为“善意取得虚开发票”甚至“恶意参与”，面临补缴税款、滞纳金甚至罚款的风险。

3. 向公安机关报案追究刑事责任

   • 若对方冒用公司名义虚开发票涉及金额较大（通常虚开税款数额在5万元以上即构成犯罪），需向公安机关经侦部门报案，追究对方虚开增值税专用发票罪的刑事责任。
     
   • 报案时需提交：被冒用发票的复印件、公司公章被伪造的证据（如印章鉴定报告）、税务机关出具的《税务处理决定书》等材料。
     
   • 法律后果：对方可能面临3年以上10年以下有期徒刑（数额较大）或10年以上有期徒刑（数额巨大）的刑罚。

4. 防范后续法律风险

   • 税务合规：向税务机关申请出具《无违法违规证明》，证明公司未参与虚开发票行为，避免影响公司纳税信用等级。
     
   • 合同审查：全面审查公司现有合同，尤其是涉及发票开具的条款，明确约定“开票方需保证发票真实性，否则承担全部法律责任”。
     
   • 公章管理：加强公章、合同章、财务章的保管，建立用章审批登记制度，避免再次被冒用。

5. 民事索赔（如适用）

   • 若对方冒用行为导致公司遭受经济损失（如被税务机关处罚、商业信誉受损等），可向法院提起民事诉讼，要求对方赔偿损失。
     
   • 需准备：损失计算依据（如税务处罚决定书、审计报告）、对方过错证据（如伪造公章的鉴定结论）等材料。

总结：被冒用虚开发票需“内部自查+税务举报+刑事报案+风险防范”四管齐下，尤其要重视证据固定和与税务、公安机关的配合。若您需要进一步协助梳理证据或起草举报材料，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您制定详细方案。