针对您提出的“被乱开发票的公司虚开发票怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、明确虚开发票的定义与严重后果

虚开发票，指的是在没有实际交易或服务的情况下开具发票，或者发票的金额、内容与实际交易存在不符。这种行为不仅违反了税收法规，还可能带来严重的法律后果，包括行政处罚（如没收违法所得、罚款）和刑事处罚（如构成虚开发票罪，面临有期徒刑、拘役或管制，并处罚金）。对于单位犯罪，还会对单位判处罚金，并追究直接负责的主管人员和其他直接责任人员的法律责任。

二、自查发现涉嫌虚开发票的处理步骤

1. 立即停止违法行为：一旦发现公司存在虚开发票的行为，必须立即停止，以避免法律责任进一步加重。

2. 内部调查与整改：

   • 成立专门的调查小组，全面深入地调查虚开发票的具体情况，包括时间、数量、金额以及参与人员等。
   • 对已虚开的发票进行作废或红冲处理（如符合规定），并调整账务，补缴因虚开发票而少缴的税款和滞纳金。

3. 咨询专业人士：及时咨询专业律师或税务师，了解可能面临的法律后果，并获得专业的应对建议，以确保后续处理合规。

三、被税务机关或司法机关调查时的应对策略

1. 全力配合调查：

   • 按照税务机关或司法机关的要求，及时、准确地提供相关资料，如合同、发票、账簿、凭证及银行账户信息等。
   • 相关人员应积极配合询问，如实陈述事实，不得拒绝、阻碍调查或提供虚假陈述。

2. 聘请专业律师：尽快聘请专业的刑事辩护律师，以获得法律帮助，指导如何应对调查和审讯，保护公司的合法权益。

3. 争取从轻处理：利用自首、立功、坦白等法定情节，积极争取从轻或减轻处罚的机会。

四、后续管理与预防措施

1. 依法接受处罚：如果公司确实存在虚开发票的行为，应依法接受税务机关的行政处罚，并采取措施改正错误。

2. 加强内部管理：建立完善的财务管理制度和发票管理制度，确保发票的合法性和真实性。加强对员工的培训和教育，提高法律意识，防止类似问题再次发生。

3. 持续法律咨询：在处理过程中及处理后，持续咨询专业律师或税务师，以确保公司的所有操作均符合法律法规要求，避免再次陷入法律风险。

总结：涉嫌虚开发票是严重的法律问题，需要公司严肃对待。通过立即停止违法行为、积极配合调查、主动整改、咨询专业人士以及加强内部管理等措施，公司可以有效减轻法律后果，并确保未来的合规运营。希望这些建议能对您有所帮助。