结论：公司支付农民工工资后起诉实际施工人不当得利是否成立，需根据具体情况判断，包括公司支付行为的性质、实际施工人与农民工的关系、以及是否存在法律上的支付义务等。以下从不同角度进行分析：
一、不当得利的构成要件
不当得利是指一方在没有合法依据的情况下获得利益，而另一方因此遭受损失。构成不当得利通常需要满足以下四个要件：
- 一方获得利益：公司支付了农民工工资，若此支付行为并非基于公司对农民工的直接债务，则公司可能因此遭受了经济上的损失（即支付了本不应支付的款项）。
- 他方受有损失：在此情境下，若公司支付工资的行为并非其法定义务或约定义务，则公司因支付而遭受了经济损失，可视为“他方受有损失”。但需注意，若公司支付工资是出于某种法律义务（如与实际施工人的合同约定），则可能不构成损失。
- 获得利益与受有损失之间有因果关系：即公司的支付行为直接导致了其经济损失，且这种损失与支付行为之间存在直接的因果关系。
- 获得利益没有法律上的原因：这是不当得利的核心要件。若公司支付工资的行为没有法律上的依据（如没有合同约定、没有法定支付义务等），则可能构成不当得利。
二、公司支付农民工工资的可能情形及分析
公司直接雇佣农民工：
- 若公司直接雇佣农民工并支付工资，则此支付行为具有法律上的原因（即雇佣关系），不构成不当得利。
公司与实际施工人签订合同，实际施工人雇佣农民工：
- 情形一：若公司按照合同约定向实际施工人支付工程款，而实际施工人未将部分或全部工程款用于支付农民工工资，导致公司另行支付农民工工资的。
- 在此情形下，公司支付农民工工资的行为可能并非其直接义务，而是出于避免法律纠纷或维护社会稳定等考虑。若公司能证明其支付行为没有法律上的原因（即没有义务直接支付农民工工资），且实际施工人因此获得了不当利益（即未将工程款用于支付农民工工资而保留了该部分款项），则公司可能构成对实际施工人的不当得利之诉。但需注意，此情形下公司需先证明其与实际施工人之间的合同约定及支付情况，以及实际施工人未将工程款用于支付农民工工资的事实。
- 情形二：若合同中明确约定公司有义务直接支付农民工工资，或实际施工人以公司名义雇佣农民工并公司同意直接支付的。
- 在此情形下，公司支付农民工工资的行为具有法律上的原因（即合同约定或同意支付），不构成不当得利。
公司误付或超额支付：
- 若公司因误付或超额支付而向农民工支付了工资，且实际施工人并未因此获得不当利益（即实际施工人并未要求或接受该部分款项），则公司可能构成对农民工的不当得利之诉（但通常农民工作为弱势群体，法院可能更倾向于保护其利益）。然而，若实际施工人因此获得了不当利益（如实际施工人指示公司向农民工支付款项以规避其自身支付义务），则公司可能构成对实际施工人的不当得利之诉。
三、判例参考
在司法实践中，类似案件的判决结果往往取决于具体案情和证据情况。例如，若公司能提供充分证据证明其支付农民工工资的行为没有法律上的原因，且实际施工人因此获得了不当利益，则法院可能支持公司的不当得利之诉。反之，若公司无法提供充分证据或实际施工人能证明公司支付行为具有法律上的原因，则法院可能驳回公司的诉讼请求。
四、建议
- 完善合同条款：公司在与实际施工人签订合同时，应明确约定工程款的支付方式、农民工工资的支付责任等条款，以避免后续纠纷。
- 保留证据：公司在支付农民工工资时，应保留相关支付凭证、合同、沟通记录等证据，以备不时之需。
- 及时咨询：若公司遇到类似纠纷，应及时咨询专业律师，以便根据具体案情制定合适的诉讼策略。
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