针对您提出的“农民合作社施工出了事故瞒报怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，必须明确的是，任何单位或个人在发生生产安全事故后，都应当严格遵守相关法律法规，及时、准确地向有关部门报告事故情况，这是法律规定的义务，也是保障人民群众生命财产安全和社会稳定的重要举措。对于农民合作社施工发生事故后瞒报的行为，是严重违反法律法规的，必须依法予以处理。
一、瞒报事故的法律后果
根据《生产安全事故报告和调查处理条例》以及《中华人民共和国安全生产法》的相关规定，生产经营单位的主要负责人对生产安全事故隐瞒不报、谎报或者迟报的，将面临严厉的行政处罚。具体来说：
二、处理瞒报事故的具体步骤
发现瞒报：一旦发现农民合作社施工发生事故后存在瞒报行为，应立即向当地应急管理部门或负有安全生产监督职责的有关部门报告。
组织调查：有关部门在接到报告后，应迅速组织事故调查组，对事故原因、经过、损失等进行全面调查，并查明瞒报事实。
依法处罚：根据调查结果，依据相关法律法规对瞒报单位和个人进行行政处罚。处罚决定应明确、具体，并依法送达被处罚单位和个人。
公开通报：为了增强警示作用，有关部门还可以将瞒报事故的处理情况向社会公开通报，以儆效尤。
三、建议与措施
加强宣传教育：通过多种渠道和形式，加强对农民合作社等生产经营单位的安全生产宣传教育，提高其法律意识和安全意识，使其充分认识到瞒报事故的严重性和危害性。
完善监管机制：建立健全安全生产监管机制，加强对农民合作社等生产经营单位的日常监管和检查，及时发现和纠正安全隐患和违法行为。
鼓励举报：建立举报奖励制度，鼓励社会公众对瞒报事故等违法行为进行举报，形成全社会共同参与安全生产监督的良好氛围。
综上所述，对于农民合作社施工发生事故后瞒报的行为，必须依法予以严厉处理，以维护法律法规的严肃性和权威性，保障人民群众的生命财产安全和社会稳定。同时，也应通过加强宣传教育、完善监管机制和鼓励举报等措施，预防和减少类似事件的发生。