结论：书面协议临时加字，并在上面手写点字后按手印，若只有乙方和中间人的手印，该修改的效力可能存在争议，具体取决于多种因素。以下从不同角度进行分析：

1. 协议修改的效力原则：

   • 根据一般的法律原则，协议的修改应当遵循双方自愿、平等、公平、诚实信用的原则，并且通常需要双方当事人的签字或盖章以确认修改内容。若只有乙方和中间人的手印，而甲方未签字或盖章，这可能引发关于修改是否得到甲方同意的争议。

2. 手印的法律效力：

   • 手印在某些情况下可以作为身份确认的一种方式，但其法律效力通常低于签字或盖章。特别是在正式的书面协议中，签字或盖章是更常见且更被广泛接受的身份确认方式。若协议中明确规定了手印可以作为确认修改的方式，或者双方当事人事先有此类约定，那么手印可能具有一定的法律效力。但若无此类明确规定或约定，仅凭手印可能难以证明修改得到了甲方的同意。

3. 中间人的角色：

   • 中间人通常作为见证人或协调人出现，其手印可能只能证明中间人见证了修改过程，但并不能直接证明甲方同意了修改内容。除非中间人具有特定的代理权限或双方当事人事先有明确约定，否则中间人的手印通常不足以使修改对甲方产生约束力。

4. 实际履行情况：

   • 如果协议修改后，双方当事人已经按照修改后的内容实际履行了协议，这可能被视为对修改内容的默认接受。然而，这种默认接受通常需要在一定条件下才能成立，如双方当事人的行为明确表明了他们对修改内容的认可。

5. 法律建议：

   • 为了避免潜在的争议和风险，建议在修改书面协议时，确保双方当事人都签字或盖章以确认修改内容。如果确实需要手写修改并加按手印，最好在协议中明确规定手印的法律效力，或者事先得到双方当事人的明确同意。
   • 如果已经发生了只有乙方和中间人手印的修改情况，建议尽快与甲方沟通并确认修改内容，必要时可以签订补充协议以明确双方的权利和义务。

可能后果：若因只有乙方和中间人的手印而导致协议修改效力存在争议，可能引发合同纠纷，甚至需要通过法律途径解决。因此，在处理此类情况时，务必谨慎并遵循相关法律法规和协议约定。

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