结论：公司旅游时提到的“申请有薪休假”是否指使用自己的年假，这主要取决于公司的具体规定和安排，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
公司规定角度：
- 许多公司会制定自己的休假政策，这些政策可能包括年假、病假、事假、婚假、产假等多种类型。在公司组织的旅游活动中，如果公司明确说明是“使用年假”来享受有薪休假，那么员工就需要按照公司的规定来申请和使用年假。
- 反之，如果公司没有明确说明，或者提供了其他类型的休假（如“公司福利假”）来支持旅游活动，那么员工就不一定需要使用自己的年假。
劳动合同与规章制度角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，员工享有休息休假的权利，而具体的休假方式和条件则通常由劳动合同和公司的规章制度来规定。
- 因此，要确定公司旅游时的“有薪休假”是否指年假，需要查阅员工的劳动合同和公司的规章制度，看其中是否有相关条款进行明确说明。
实际操作与沟通角度：
- 在实际操作中，如果员工对公司旅游时的休假政策有疑问或不明确的地方，建议及时与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，以明确具体的休假方式和条件。
- 通过沟通，员工可以更好地了解公司的政策，避免因为误解或不清楚规定而产生不必要的纠纷或损失。
法律后果与权益保护角度：
- 如果公司未经员工同意，擅自将公司旅游活动与员工的年假挂钩，或者未按照劳动合同和规章制度的规定来安排休假，那么员工有权向公司提出异议，并要求公司按照法律规定和合同约定来安排休假。
- 在必要时，员工还可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
建议：作为员工，在面对公司旅游时的休假政策时，应仔细阅读劳动合同和公司的规章制度，了解具体的休假方式和条件。如果有任何疑问或不明确的地方，及时与公司进行沟通，以确保自己的权益得到保障。同时，也建议公司制定明确、合理的休假政策，并在组织旅游活动时提前告知员工相关的休假安排和条件，以避免不必要的纠纷和误解。
示例：假设某公司计划组织一次旅游活动，并在通知中说明“员工需申请年假来享受此次有薪旅游”。在这种情况下，员工就需要按照公司的规定来申请和使用年假。如果员工没有足够的年假或者不想使用年假来参加旅游活动，那么员工可以与公司进行沟通，看是否有其他解决方案或者是否可以放弃参加此次旅游活动。