结论：即使您与石材厂签订了保密协议和赔偿协议，如果其24小时施工产生的噪音超过了法定标准，您仍然有权向相关部门投诉或向法院提起诉讼，要求其停止侵害并赔偿损失。

分析如下：

1. 噪音污染的法律界定：

   • 根据《中华人民共和国环境噪声污染防治法》的相关规定，工业生产活动产生的噪音如果超过了国家规定的环境噪声排放标准，并干扰他人正常生活、工作和学习，即构成噪音污染，属于违法行为。

2. 保密协议和赔偿协议的法律效力：

   • 保密协议和赔偿协议是您与石材厂之间就特定事项（如商业秘密保护、损害赔偿等）达成的合意，它们并不具有排除或限制您依法享有其他权利（如环境权、健康权等）的效力。
   • 如果石材厂的噪音污染行为违反了法律法规，即使双方签订了相关协议，也不能成为其免责的理由。

3. 您的权利与救济途径：

   • 投诉：您可以向当地环保部门或城市管理部门投诉石材厂的噪音污染行为，要求相关部门进行调查并采取措施制止。
   • 诉讼：如果噪音污染行为给您造成了实际损害（如听力下降、精神损害等），您还可以向法院提起民事诉讼，要求石材厂承担停止侵害、赔偿损失等民事责任。

4. 协议内容对诉讼的影响：

   • 如果赔偿协议中已经就噪音污染可能造成的损害约定了赔偿方式和标准，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么在诉讼中，法院可能会参考该协议来确定赔偿金额。
   • 但如果协议内容存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，或者协议未涵盖您实际遭受的损害，您仍有权在诉讼中提出超出协议范围的赔偿请求。

建议：

• 在采取法律行动前，建议您先收集相关证据，如噪音监测报告、现场照片、视频等，以证明石材厂的噪音污染行为及其对您造成的损害。
• 如果您对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到充分保障，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。

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