保险公司代位追偿时，先垫付的修车费用一般是全额支付，不会因次责而直接扣除相应部分，但后续追偿时会根据责任比例向责任方主张赔偿。具体分析如下：

1. 垫付修车费用环节
   当您的车辆因他人责任受损且您向保险公司申请代位追偿时，保险公司会基于保险合同约定，先行全额垫付您的修车费用（需您提供维修发票等凭证）。此时保险公司不会因您承担次责而直接扣除部分费用，因为代位追偿的核心是保险公司先履行对您的赔偿义务，再取代您的地位向责任方追偿。

2. 后续追偿环节
   保险公司垫付后，会以您的名义向责任方（如对方车主或其保险公司）追偿全部损失。但实际追偿时，会按事故责任比例划分赔偿金额。例如：若您承担30%次责、对方承担70%主责，保险公司理论上只能向对方追偿70%的损失，剩余30%可能需通过您的车险（如车损险）或自行承担（若未投保相关险种）。不过，这一比例划分不影响保险公司前期对您全额垫付的承诺。

3. 特殊情形说明

   • 若您的车险条款中有“绝对免赔率”等约定（如未投保不计免赔险），保险公司可能在垫付时扣除免赔部分，但这是基于保险合同约定，与代位追偿的责任比例无关。
     
   • 若责任方无赔偿能力（如未投保、逃逸等），保险公司垫付后可能无法全额追偿，此时您可能需承担部分损失（具体看保险合同条款）。

建议：若涉及代位追偿，务必保留事故认定书、维修发票等证据，并配合保险公司向责任方追偿。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程或责任划分细节。