核心结论：农村自建房若被认定为违建且未签订拆迁补偿合同，需根据违建认定合法性、是否面临拆迁、是否已收到行政决定等不同情况，采取针对性措施维护权益。以下是具体分析：

1. 先确认违建认定的合法性

若房屋被认定为违建，需第一时间核实认定程序是否合法。根据《城乡规划法》第64条，违建认定需由县级以上城乡规划部门或乡镇政府（依据地方授权）作出，且需满足以下条件：

• 程序合法：需经过调查取证、告知陈述申辩权、作出书面决定等法定程序；
• 事实清楚：需明确房屋未取得建设工程规划许可证（或乡村建设规划许可证），且无法通过补办手续消除影响。

若认定程序违法（如未送达决定书、未听取陈述申辩），可向法院提起行政诉讼，请求撤销违建认定，为后续协商或维权争取空间。

2. 若违建认定合法，需区分是否面临拆迁

（1）未面临拆迁：争取补办手续或保留房屋

若房屋虽被认定为违建，但未被纳入拆迁范围，可尝试通过补办手续“转正”：

• 补办规划许可：若房屋符合土地利用总体规划和城乡规划，可向当地规划部门申请补办建设工程规划许可证；
• 申请“历史遗留问题”处理：部分地区对2008年《城乡规划法》实施前建成的房屋，可按“历史遗留问题”补办手续或缴纳罚款后保留。

（2）面临拆迁：争取合理补偿

若房屋被认定为违建且面临拆迁，需明确：违建不等于无补偿。根据《行政强制法》第44条和《国有土地上房屋征收与补偿条例》第24条，即使房屋被认定为违建，拆迁方也需依法履行以下程序：

• 催告程序：作出强制执行决定前，需书面催告当事人履行义务，并告知陈述申辩权；
• 补偿协商：若房屋因历史原因未取得许可，或拆迁方未依法履行调查、公示程序，可主张“适当补偿”（如房屋重置成本价、搬迁费等）；
• 行政复议或诉讼：若对拆迁补偿方案或强制执行决定不服，可在60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。

3. 若已收到《限期拆除决定书》，需立即行动

若收到规划部门或乡镇政府作出的《限期拆除决定书》，需在法定期限内（通常为60日）采取以下措施：

• 申请行政复议：向上一级政府或规划部门申请复议，请求撤销决定；
• 提起行政诉讼：直接向法院起诉，主张决定违法（如程序违法、事实认定错误）；
• 避免强制执行：若未在法定期限内复议或诉讼，拆迁方可能申请法院强制拆除，此时需尽快与拆迁方协商或通过法律程序暂缓执行。

4. 关键提醒：保留证据，及时维权

无论采取哪种措施，均需保留以下证据：

• 房屋建设时间、用途、投入成本等证明材料（如照片、视频、证人证言）；
• 违建认定文书、拆迁公告、补偿方案等官方文件；
• 与拆迁方的沟通记录（如录音、书面材料）。

最后建议：农村自建房问题涉及土地管理、城乡规划、行政强制等多部法律，情况复杂。若您对违建认定、拆迁补偿或维权程序有疑问，可直接向我咨询，我会结合您所在地区的具体政策，为您制定针对性方案。