父子协议书在一般情况下是没有法律效力的，但具体还需根据协议内容及父子关系的性质来判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、基于自然血亲的父子关系
协议无效的原因：
- 自然血亲的父子关系是基于子女出生的事实而产生的，这种关系在法律上是不可解除的。即使双方签订了所谓的“父子协议书”，也无法改变这一事实。
- 法律对身份关系有着严格的保护机制，不允许通过私人协议来随意变更或解除。父子关系作为最基本的身份关系之一，受到法律的特别保护。
- 断绝父子关系的行为违背了社会公德和善良风俗，损害了家庭伦理和社会秩序。因此，这类协议在内容上就是违法的，无法产生法律效力。
实际影响与法律后果：
- 即使签订了断绝父子关系的协议，父母对未成年子女仍负有抚养、教育、保护的义务，成年子女对父母也负有赡养、扶助和保护的义务。这些义务是法定的，无法通过协议来免除。
- 签订此类协议可能会引发更多的家庭纠纷和法律问题。例如，在财产分割、继承权等方面可能会产生争议，甚至可能导致诉讼。
二、基于拟制血亲的父子关系
协议可能有效的情况：
- 拟制血亲，如养父母与养子女间的关系，虽无实际血缘关联，但法律上赋予其等同于血亲的地位。与自然血亲不同，拟制血亲的父子关系在满足特定法律条件和程序的前提下是可以解除的。
- 具体而言，如果养父母与成年养子女之间关系恶化至无法共同生活，双方可协商解除收养关系；协商不成时，可向人民法院提起诉讼。解除收养关系必须遵循法定程序，包括到民政部门办理相关登记手续。一旦收养关系依法解除，养父子间原有的权利义务关系随即终止。
注意事项：
- 解除拟制血亲的父子关系并非基于双方的简单协议，而是严格依照法律规定的程序和条件进行。因此，即使双方签订了协议，也必须确保协议内容符合法律要求，并按照法定程序办理相关手续。
三、法律建议
面对家庭矛盾或纠纷时：
- 应寻求专业的法律咨询和帮助，而不是试图通过签订“父子协议书”来解决争端。这类协议不仅无法律效力，还可能加剧家庭矛盾，不利于问题的妥善解决。
- 正确的做法是通过合法途径，如调解、诉讼等，来维护自身权益，确保问题得到公正、合理的处理。
签订协议时：
- 如果确实需要签订与父子关系相关的协议，应确保协议内容合法、合规，并明确双方的权利和义务。同时，建议咨询专业律师，以确保协议的法律效力和可执行性。
总结来说，父子协议书在一般情况下是没有法律效力的，尤其是基于自然血亲的父子关系。对于拟制血亲的父子关系，虽然有可能在满足特定条件下解除，但也必须遵循法定程序和要求。因此，在处理相关问题时，应遵循法律规定，尊重法律权威，以合法、合理的方式解决家庭矛盾和纠纷。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。