代理机构付专家评审费是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果代理机构与委托方（如企业、政府机构等）在合同中明确约定了代理机构需要支付专家评审费，并且该费用是作为代理服务的一部分或者作为完成特定任务的必要支出，那么这种支付行为是合法的。因为合同是双方自愿达成的协议，只要不违反法律法规的强制性规定，就应当受到法律保护。

2. 法律法规角度：

   • 在没有特定合同约定的情况下，代理机构支付专家评审费是否合法，需要看相关法律法规是否有明确规定。一般来说，如果专家评审费是合理且必要的支出，且没有违反相关法律法规（如反腐败法、商业贿赂法等）的禁止性规定，那么这种支付行为可能是合法的。
   • 然而，如果专家评审费的支付存在不正当利益输送、行贿受贿等违法行为，或者违反了相关行业的规定和道德准则，那么这种支付行为就是违法的。

3. 行业惯例角度：

   • 在某些行业或领域，支付专家评审费可能是一种常见的做法或惯例。如果这种做法在行业内被广泛接受，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么代理机构支付专家评审费可能是合法的。但需要注意的是，行业惯例不能作为违法的借口，如果行业惯例本身违反了法律法规，那么这种惯例是不受法律保护的。

4. 实际操作建议：

   • 对于代理机构来说，在支付专家评审费之前，应当仔细审查合同条款和相关法律法规，确保支付行为的合法性。
   • 如果对支付行为的合法性存在疑问，建议咨询专业律师或相关监管机构，以获取准确的法律意见和指导。
   • 同时，代理机构应当建立健全的内部控制制度，加强对支付行为的监督和管理，防止出现违法行为。

总结来说，代理机构付专家评审费是否合法，取决于合同约定、法律法规、行业惯例以及实际操作中的具体情况。如果支付行为符合合同约定、法律法规和行业惯例，且没有违反相关禁止性规定，那么这种支付行为就是合法的。如果有任何疑问或不确定之处，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。