总承包单位已付清农民工工资的法律依据主要来源于《保障农民工工资支付条例》的相关规定，以下从不同角度为您详细阐述：

1. 建设单位与总承包单位的责任划分：

   • 根据《保障农民工工资支付条例》第二十九条，建设单位有义务按照合同约定及时拨付工程款，并将人工费用及时足额拨付至农民工工资专用账户。这是确保农民工工资能够按时足额支付的前提。
   • 总承包单位则负责具体支付农民工工资，并接受建设单位的监督。若总承包单位已按照规定付清农民工工资，则其责任已履行完毕。

2. 建设单位未拨付工程款导致欠薪的处理：

   • 若因建设单位未按照合同约定及时拨付工程款导致农民工工资拖欠，建设单位应当以未结清的工程款为限先行垫付被拖欠的农民工工资。这一规定确保了即使建设单位未按时拨款，农民工的工资也能得到保障。
   • 在此情况下，若总承包单位已付清农民工工资，则意味着其并未因建设单位的未拨款行为而拖欠工资，因此总承包单位无需承担额外责任。

3. 总承包单位已付清工资的证明与监督：

   • 总承包单位应保留好支付农民工工资的相关凭证，如工资单、转账记录等，以证明其已按时足额支付工资。
   • 建设单位应加强对总承包单位按时足额支付农民工工资的监督，确保工资支付到位。若建设单位发现总承包单位存在拖欠工资的情况，应及时督促其支付，并可向相关部门报告。

4. 实际案例与法律后果：

   • 假设某工程项目中，建设单位已按照合同约定及时拨付了工程款和人工费用，总承包单位也按时足额支付了农民工工资。在此情况下，若发生农民工讨薪事件，经核实后确认总承包单位已付清工资，则农民工应无法再向总承包单位或建设单位主张工资支付。
   • 反之，若总承包单位未按时足额支付农民工工资，则可能面临法律责任，包括被责令限期支付、加付赔偿金等。同时，建设单位若未履行好监督职责或未按时拨付工程款导致欠薪，也可能承担相应责任。

总结与建议：

• 总承包单位已付清农民工工资的法律依据主要来源于《保障农民工工资支付条例》中关于建设单位与总承包单位责任划分的规定。
• 为确保工资支付到位，总承包单位应保留好支付凭证，并接受建设单位的监督。建设单位则应按时拨付工程款和人工费用，并加强对总承包单位的监督。
• 若您在实际操作中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。