公司放假是否会扣除底薪以及是否合法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
因公司原因放假
一个工资支付周期内：
- 若公司因自身原因（如订单不足、设备检修等）安排员工放假，且时间未超出一个工资支付周期，公司应按劳动合同约定的标准支付员工工资。此时扣除底薪是不合法的。例如，月工资约定为5000元，若在此周期内放假，员工应获得全额5000元工资。
超过一个工资支付周期：
- 若放假时间超出上述周期，且员工提供了正常劳动，公司支付的报酬不得低于当地最低工资标准。
- 若员工未提供正常劳动，公司应按当地规定支付生活费，标准通常不低于最低工资的一定比例（如70%-80%，具体依地方规定）。在此情况下，按规定支付生活费或不低于最低工资标准的报酬，扣除底薪不属于违法；反之，则不合法。
因员工个人原因请假
- 若员工因个人原因（如事假）请假，公司可根据规章制度扣除相应底薪。但需满足以下条件：
- 规章制度需经民主程序制定，并向员工公示告知。
- 扣除标准应合理，不得过度克扣。若公司规章制度合法且已公示，且按照规定执行，则扣除底薪是合法的。
法定节假日和带薪假期
- 依据《劳动法》及《职工带薪年休假条例》，劳动者在法定节假日（如元旦、春节等）及带薪年休假期间，用人单位应依法支付工资。若公司在这些法定带薪假期内放假却未发底薪，属于违法行为。劳动者有权要求公司支付相应工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
法律建议：
劳动者：
- 面对公司不当扣薪行为，首先应与公司协商沟通，要求说明扣薪原因并提供依据。
- 协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护合法权益。
- 必要时，可通过法律途径进一步追究责任。
公司：
- 应确保自身规章制度的合法性及合规性，避免不必要的法律纠纷。
- 在安排放假时，应明确告知员工放假原因、期限及工资支付情况，确保员工的知情权。
可能法律后果：
- 若公司违法扣除底薪，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付工资报酬、加付赔偿金等。
- 劳动者有权要求公司支付被扣除的底薪及可能的赔偿金，并可通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，公司放假是否会扣除底薪以及是否合法，取决于放假的具体原因、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。劳动者应了解自己的权益，并在权益受损时积极采取措施保护自己的合法权益不受侵犯。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。