关于人社部规定的停工留薪期工资以及加班费的计算问题，这是一个涉及职工权益保障的重要话题。下面我将结合相关法律法规，为您详细解答。
一、停工留薪期工资的计算原则
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在停工留薪期内，其原工资福利待遇应保持不变。这意味着，无论职工平时的工资结构如何，停工留薪期内的工资都应按照其受伤或患职业病前的正常出勤月工资来计算，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。
二、具体计算方式
固定工资制职工：
- 对于实行固定工资制的职工，停工留薪期工资一般按照其受伤前12个月的平均工资来计算。如果职工平时按照固定的计时工资标准领取报酬，也可直接按其受伤前正常出勤月的计时工资计算。
非固定工资制职工：
- 对于工资不固定的职工，如计件工资、提成工资等，停工留薪期工资则需根据其受伤前一定时期（如6个月或12个月）内的月平均工资来确定。若职工工作不满上述时期，则按实际工作月份的平均工资计算。
- 在特殊情况下，如职工发生工伤前工作尚未满一个月且未支付工资，则按劳动合同约定的月工资计算；若未签合同或未约定，则可参照当地同行业平均工资水平或依据劳动仲裁、法院的判定来确定。
加班费的处理：
- 加班费作为职工正常出勤月工资的一部分，也应计入停工留薪期工资的计算中。但需要注意的是，加班费是基于职工实际加班情况而支付的，因此在停工留薪期内，由于职工未实际加班，所以不会产生新的加班费。然而，如果职工在受伤前有未支付的加班费，这部分费用应计入其受伤前的月平均工资中，从而影响停工留薪期工资的计算。
三、停工留薪期限
- 停工留薪期一般不超过12个月，这是《工伤保险条例》所明确规定的。伤情严重或者情况特殊时，需经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后方可适当延长，但延长的期限也不得超过12个月。
四、其他注意事项
伤残待遇与医疗待遇：
- 工伤职工评定伤残等级后，将停发原停工留薪期待遇，转而按照相关规定享受伤残待遇。
- 工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，可以继续享受工伤医疗待遇。
护理责任：
- 生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。
法律维权：
- 如果单位不按照规定支付停工留薪期工资或加班费（如之前有未支付的），工伤职工可以通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，停工留薪期工资的计算应严格遵循相关法律法规，确保职工的合法权益得到保障。同时，用人单位也应依法履行支付义务，包括之前可能未支付的加班费部分（如果计入月平均工资的话），以避免不必要的法律纠纷。希望这些解答能对您有所帮助。