核心结论：针对五年前工程现在公安发现两公司串标的情况，需分情况讨论法律责任及应对措施，具体如下：

1. 关于串标行为的法律定性及追责时效
   根据《刑法》第八十七条，法定最高刑为五年以下有期徒刑的犯罪，追诉时效为五年。串通投标罪（《刑法》第二百二十三条）的法定刑为三年以下有期徒刑或拘役，因此若公安发现时已超过五年，原则上不再追究刑事责任。但需注意：

   • 若串标行为涉及其他犯罪（如行贿、贪污等），且法定刑更高，则可能适用更长的追诉时效；
     
   • 若公安已立案但未超过追诉时效，或行为被认定为“连续犯罪”（如多次串标），则可能突破时效限制。

2. 行政责任与民事赔偿的独立性
   即使刑事追责时效已过，行政责任和民事赔偿仍可能被追究：

   • 行政责任：根据《招标投标法》第五十三条，串标行为可被处以罚款、没收违法所得、吊销营业执照等行政处罚，且行政处罚的时效为二年（自违法行为发生之日起计算）。若五年内未被行政机关发现，则不再给予行政处罚；
     
   • 民事赔偿：受害方（如招标人）可依据《民法典》第一百八十八条，在知道或应当知道权利受损之日起三年内提起民事诉讼，要求串标方赔偿损失。若招标人五年内未主张权利，可能因诉讼时效届满而丧失胜诉权，但若存在诉讼时效中断情形（如多次催告、协商等），则时效可能重新计算。

3. 当前应对建议

   • 核实公安立案依据：要求公安出具《立案决定书》，明确涉嫌罪名及事实依据，判断是否涉及其他犯罪或追诉时效问题；
     
   • 评估证据完整性：串标行为需以“投标人相互串通报价”或“与招标人串通”等证据为前提，若证据不足或已灭失（如五年前的投标文件、沟通记录等），可主张事实不清、证据不足；
     
   • 主动配合调查：若确存在串标行为，可考虑主动退还违法所得、赔偿损失，争取从轻或减轻处罚（如行政处罚中的“主动消除危害后果”情形）；
     
   • 咨询专业律师：针对具体案情（如串标方式、金额、是否涉及公职人员等），制定辩护策略或赔偿方案。

总结：五年前的串标行为是否仍需承担责任，需结合刑事追诉时效、行政处罚时效及民事诉讼时效综合判断。建议尽快委托律师介入，通过法律程序维护权益。如有进一步细节（如串标方式、金额、是否已被采取强制措施等），可直接向我咨询。