政府与企业之间进行土地、房屋回购的主要法律依据包括《中华人民共和国民法典》《中华人民共和国土地管理法》《中华人民共和国城市房地产管理法》及相关行政法规、地方性法规，具体适用需结合回购目的、程序及补偿标准综合判断。以下从不同法律维度展开分析：
1. 《民法典》中的基础性规定
- 合同自由原则：政府与企业之间的回购行为本质属于民事合同关系，需遵循《民法典》合同编关于“平等自愿、等价有偿”的原则。双方可通过协商签订回购协议，明确回购标的、价格、支付方式及违约责任等条款。
- 公序良俗与国家利益：若回购涉及公共利益（如城市更新、基础设施改造），需符合《民法典》第153条关于“违反公序良俗的民事法律行为无效”的规定，确保回购目的合法。
- 行政协议的特殊性：若政府以行政主体身份参与回购（如征收补偿），则需适用《民法典》中关于行政协议的规定，强调程序合法性及补偿合理性。
2. 《土地管理法》中的土地回购依据
- 征收与补偿：根据《土地管理法》第2条、第47条，政府为公共利益需要可依法征收企业土地，并给予“公平、合理”的补偿。回购价格通常需参考土地原用途、市场价值及地上附着物价值，确保企业合法权益不受损。
- 集体土地回购：若涉及农村集体土地，需符合《土地管理法》第63条关于“集体经营性建设用地入市”的规定，回购程序需经村民会议或村民代表会议同意，并报县级政府批准。
3. 《城市房地产管理法》中的房屋回购规则
- 房屋征收与补偿：根据《城市房地产管理法》第6条，政府为城市规划需要可征收企业房屋，补偿标准需参照《国有土地上房屋征收与补偿条例》，包括房屋价值、搬迁费用及停产停业损失等。
- 房屋买卖合同效力：若回购基于双方自愿协商（如企业因经营调整需出售房屋），需符合《城市房地产管理法》第41条关于“房地产转让合同”的规定，确保合同内容合法、手续完备。
4. 行政法规与地方性法规的补充
- 《国有土地上房屋征收与补偿条例》：明确征收程序（如公告、评估、听证）及补偿标准，为政府回购企业房屋提供具体操作指引。
- 地方性法规：部分地区（如深圳、上海）出台了城市更新条例，对政府回购企业土地、房屋的流程、补偿方式及争议解决机制作出细化规定，需结合当地政策执行。
5. 程序合法性要求
- 公共利益认定：政府需证明回购行为符合《土地管理法》第45条规定的“公共利益”情形（如国防、交通、能源等），否则可能被认定为违法。
- 听证与公示：回购过程中需履行听证程序，保障企业知情权、参与权，并通过公示确保程序透明。
- 司法审查：企业对回购补偿标准有异议的，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，由法院对回购行为的合法性进行审查。
实务建议
- 明确回购目的：政府需清晰界定回购是否基于公共利益，避免以“回购”名义实施违法征收。
- 合理确定补偿标准：建议委托第三方评估机构对土地、房屋价值进行评估，确保补偿公平。
- 完善协议条款：回购协议中需明确违约责任、争议解决方式（如仲裁或诉讼），降低后续纠纷风险。
若您涉及具体回购项目，可进一步提供回购目的、土地性质（国有/集体）、房屋用途等细节，我将为您分析具体法律风险及应对方案。