工厂要求员工进行体检，在大多数情况下是合法的，但具体是否合法需依据员工所从事的工作性质以及相关法律法规来判断。

首先，我们要明确的是，对于从事接触职业病危害作业的劳动者，工厂要求其进行体检是法定义务。根据《中华人民共和国职业病防治法》的相关规定，用人单位应当按照国务院卫生行政部门的规定，组织从事接触职业病危害作业的劳动者进行上岗前、在岗期间和离岗时的职业健康检查，并将检查结果书面告知劳动者。这是为了保护劳动者的身体健康，预防职业病的发生。

职业健康检查与一般的健康体检有所不同。它更侧重于筛查职业病、疑似职业病以及职业禁忌症，其适用对象是用人单位中从事接触职业病危害因素作业的劳动者。因此，如果员工所从事的工作涉及接触职业病危害因素，那么工厂要求其进行体检就是合法且必要的。

此外，工厂要求员工进行体检还有助于企业自身的风险管理。通过体检，企业可以及时发现员工是否存在职业禁忌症，从而避免员工因接触职业病危害因素而遭受健康损害，进而减少企业可能面临的法律纠纷和经济损失。

然而，如果员工所从事的工作并不涉及接触职业病危害因素，那么工厂要求其进行体检的合法性就需要根据具体情况来判断。一般来说，如果工厂出于对员工健康的关心和保障，自愿组织员工进行体检，这是值得鼓励的。但如果工厂以不合理的理由强制要求员工进行体检，或者体检内容与工作性质无关，那么这种要求可能就不合法了。

综上所述，工厂要求员工进行体检是否合法，主要取决于员工所从事的工作性质以及相关法律法规的规定。对于从事接触职业病危害作业的劳动者，工厂要求其进行体检是合法且必要的；对于其他员工，工厂则应根据实际情况和法律法规的要求来合理组织体检。如果您对工厂的体检要求有疑问或担忧，建议您咨询专业的法律人士或劳动监察部门以获取更准确的解答和帮助。