核心结论：若工伤案件中对方在二审撤诉，且涉及分两次赔偿的情况，需根据撤诉原因、赔偿协议内容等具体情形来处理，一般可按以下思路应对：

1. 确认撤诉原因及法律后果
   • 对方在二审撤诉，通常意味着其放弃了通过二审程序解决纠纷的权利，一审判决（若有）将生效，或者案件回到一审前的状态（若一审未判决）。如果是基于双方达成和解而撤诉，那么要重点关注和解协议中关于赔偿的约定。
   • 例如，若之前一审已经判决对方承担一定的赔偿责任，对方上诉后在二审撤诉，那么一审判决就生效了，对方应按照一审判决的内容履行赔偿义务。如果双方在二审期间自行达成了新的赔偿协议，对方撤诉，就要看新协议对赔偿次数、金额、时间等是如何约定的。
2. 关于分两次赔偿的处理
   • 若赔偿协议有明确约定：如果双方签订的赔偿协议中明确规定了分两次赔偿的具体事项，包括每次赔偿的金额、时间、方式等，那么对方应按照协议的约定履行。若对方未按约定支付第二次赔偿款，你可以依据协议向对方发送催告函，要求其在合理期限内支付；若对方仍不支付，你可以向法院提起诉讼，要求对方履行协议并承担违约责任。
   • 若赔偿协议无明确约定或没有协议：在这种情况下，需要结合实际情况和法律规定来处理。如果之前有相关的判决或调解书，可参照其中的内容与对方协商赔偿事宜。若协商不成，你可以收集相关证据，如工伤认定书、劳动能力鉴定结论、医疗费用票据等，证明自己的损失情况，然后向法院提起诉讼，要求对方进行赔偿。法院会根据双方的过错程度、实际损失等因素来确定赔偿金额和支付方式。
3. 后续行动建议
   • 保留证据：无论对方撤诉的原因是什么，都要保留好与工伤事故、赔偿相关的所有证据，如事故现场照片、证人证言、医疗记录、赔偿协议等。这些证据在后续的协商或诉讼中都将起到关键作用。
   • 及时沟通：与对方保持沟通，了解其撤诉的真实意图和后续赔偿的计划。如果对方有合理的困难导致无法按时赔偿，可以协商适当的延期或分期方案，但一定要签订书面协议，明确双方的权利和义务。
   • 寻求法律帮助：如果在处理过程中遇到复杂的法律问题或对方不配合的情况，可以随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。

总之，面对工伤对方二审撤诉且涉及分两次赔偿的情况，要冷静分析，依据法律规定和实际情况来维护自己的合法权益。