针对“分公司用假印章签订合同拖欠农民工工资”这一问题，核心结论是可通过民事追偿、行政投诉、刑事控告等多途径维权，需结合证据固定、主体确认、程序选择等关键步骤推进。以下是具体分析：

一、民事追偿：以合同相对性为基础，突破假印章障碍

1. 确认合同效力与责任主体
   根据《民法典》第490条，若农民工能证明合同系分公司实际履行（如工资发放记录、工作安排证据等），即使印章为假，法院可能认定分公司为实际合同主体，需承担支付工资责任。若分公司无独立财产，可依据《公司法》第14条，直接起诉总公司承担连带责任。

2. 证据固定要点

   • 收集工作证明：如工牌、考勤记录、工作群聊天记录等，证明劳动关系存在；
     
   • 固定工资拖欠证据：如欠条、工资条、银行流水（显示未支付记录）等；
     
   • 印章鉴定申请：若对印章真实性存疑，可在诉讼中申请司法鉴定，但需注意，若分公司实际履行合同，印章真假可能不影响责任认定。

二、行政投诉：快速启动官方介入程序

1. 向劳动监察部门投诉
   依据《劳动保障监察条例》第11条，劳动监察部门有权对拖欠工资行为进行调查、责令支付，并可对用人单位处以罚款。投诉时需提交：

   • 身份证明及劳动关系证明；
     
   • 拖欠工资的证据材料；
     
   • 分公司及总公司基本信息（可通过国家企业信用信息公示系统查询）。

2. 申请劳动仲裁
   若投诉未果，可依据《劳动争议调解仲裁法》第5条申请仲裁，主张工资及经济补偿金（如未签合同的双倍工资差额）。仲裁裁决后，用人单位不履行的，可申请法院强制执行。

三、刑事控告：针对假印章背后的违法行为

1. 报案追究伪造公司印章罪
   若假印章系分公司负责人或相关人员私刻，可依据《刑法》第280条向公安机关报案，追究其刑事责任。刑事立案后，可推动公安机关追缴赃款，用于支付工资。

2. 注意刑事与民事的衔接
   刑事案件中，农民工可作为被害人参与诉讼，主张退赔损失；同时，刑事追缴不影响民事诉讼的独立进行，可同步推进以最大化维权效果。

四、特殊情形处理：总公司责任与执行保障

1. 总公司连带责任的认定
   若分公司无独立财产，或总公司存在滥用法人独立地位（如财产混同、过度控制等），可依据《公司法》第20条主张总公司承担连带责任。需提供：

   • 分公司财产不足以清偿的证据（如执行裁定书）；
     
   • 总公司与分公司财产混同的证据（如资金往来记录、财务账目等）。

2. 执行阶段的保障措施
   若胜诉后分公司无财产可供执行，可申请将总公司列为被执行人，或依据《民事诉讼法》第243条，申请执行总公司的其他财产（如银行账户、房产等）。

行动建议：

1. 立即收集证据（尤其是工作证明和工资拖欠证据）；
   
2. 向当地劳动监察部门投诉，同步准备劳动仲裁材料；
   
3. 咨询律师评估是否报案追究刑事责任；
   
4. 若涉及总公司责任，同步收集财产混同证据。
   

如有进一步疑问或需协助处理具体案件，可直接向我咨询，我将结合证据情况为您制定详细维权方案。