结论前置：您在公司工作两年，国家法定假日单位都没有给三薪，在仲裁时是有可能追回这部分工资的，但具体能否成功以及追回的金额，需结合实际情况和证据来判断。
法律背景与解释：
法定假日三薪的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这意味着，在法定假日工作，您有权获得三倍的工资。
仲裁追回的可能性：
- 如果您能提供充分的证据证明在法定假日工作了但未获得三倍工资，如考勤记录、工资条、工作安排通知等，那么在劳动仲裁中，您是有可能追回这部分工资的。
- 仲裁机构会根据您提供的证据以及单位的反驳证据，来判定单位是否应支付您法定假日的三倍工资。
可能面临的挑战：
- 单位可能会提出各种理由来反驳您的主张，如称您未在法定假日工作、已通过调休方式补偿等。因此，您需要准备充分的证据来支持您的主张。
- 如果单位能提供有效证据证明已支付您法定假日的三倍工资或您未在法定假日工作，那么您的仲裁请求可能会被驳回。
仲裁流程与注意事项：
- 您需要向当地的劳动仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
- 仲裁委员会会安排开庭审理，双方需要出庭陈述自己的主张和提供证据。
- 仲裁委员会会根据双方的主张和证据作出裁决。如果对裁决结果不服，您还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
法律建议：
- 收集证据：尽快收集与法定假日工作相关的证据，如考勤记录、工资条、工作安排通知、同事证言等。这些证据将对您在仲裁中主张权利至关重要。
- 咨询专业律师：虽然我可以为您提供法律咨询，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，我建议您在准备仲裁前咨询一位专业律师，以便更准确地评估您的案件情况和制定策略。
- 注意仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，您需要确保在法定期限内提起仲裁申请。
可能的结果与后续行动：
- 如果仲裁成功，单位将被要求支付您法定假日的三倍工资差额。
- 如果仲裁失败，您还可以考虑向人民法院提起诉讼来维护自己的权益。但请注意，诉讼过程可能更加复杂和耗时，因此您需要做好充分的准备。
最后，我希望您能顺利追回应得的工资。如果您在准备仲裁过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。