结论：贷款利息扣了一部分，第二天扣了剩余款项，这种情况是否算逾期，主要取决于贷款合同中的具体约定以及贷款机构的相关规定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 合同有明确约定：如果贷款合同中明确规定了利息的支付方式和时间，包括是否允许分次扣款以及分次扣款的具体时间节点，那么应当按照合同约定来执行。若合同中允许分次扣款，并且第二天扣款是在合同约定的时间范围内，则不算逾期。
   • 合同无明确约定：如果贷款合同中没有明确规定利息的支付方式和时间，或者规定较为模糊，那么就需要参考贷款机构的相关规定或者行业惯例。

2. 贷款机构规定角度：

   • 机构有明确规定：贷款机构可能会根据自己的运营情况和风险管理需要，制定关于利息支付的具体规定。如果贷款机构允许利息分次扣款，并且第二天扣款符合其规定，则不算逾期。
   • 机构无明确规定或规定不明确：在这种情况下，如果贷款机构在扣款前没有与借款人进行充分沟通，导致借款人误以为已经全额支付了利息，而实际上还有剩余款项未扣，那么借款人可以与贷款机构进行协商，寻求合理的解决方案，此时一般也不应直接认定为逾期。

3. 实际操作与法律后果角度：

   • 实际操作：在实际操作中，如果贷款机构在扣款时出现了部分扣款的情况，并且第二天扣款了剩余款项，借款人应及时与贷款机构沟通，确认扣款情况，并保留好相关证据，如扣款记录、合同文本等。
   • 法律后果：如果因为部分扣款导致借款人被误认为逾期，并因此产生了罚息、违约金等额外费用，借款人可以根据合同约定和法律规定，与贷款机构进行协商，要求减免或调整相关费用。如果协商无果，借款人还可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

建议：

• 仔细阅读合同：借款人在签订贷款合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于利息支付方式和时间的规定，确保自己清楚了解并同意相关条款。
• 与贷款机构沟通：如果遇到利息扣款问题，借款人应及时与贷款机构沟通，了解扣款情况，并寻求合理的解决方案。
• 保留证据：借款人应保留好与贷款相关的所有证据，如合同文本、扣款记录、沟通记录等，以备不时之需。

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