关于贷款还款日第二天扣款是否算逾期的问题，这主要取决于您与贷款机构签订的贷款合同中的具体约定，以及贷款机构是否提供了还款宽限期。

一、贷款合同中的约定

首先，您需要仔细查阅贷款合同，特别是关于还款期限和宽限期的条款。合同中通常会明确规定还款日，以及是否允许在还款日之后的一段时间内（即宽限期）进行还款而不被视为逾期。

1. 如果合同中有明确的宽限期，且宽限期大于等于一天： 那么，在还款日第二天进行的还款仍然被视为按时还款，不会产生逾期利息，也不会对您的信用记录造成负面影响。

2. 如果合同中没有宽限期，或者宽限期小于一天： 那么，还款日第二天进行的还款将被视为逾期。此时，贷款机构可能会按照合同约定收取逾期违约金，并有可能将逾期信息报送至征信系统，对您的个人信用产生不利影响。

二、贷款机构的宽限期政策

除了合同中的约定外，您还需要了解贷款机构的具体宽限期政策。有些贷款机构可能会根据市场情况、客户信用状况等因素，灵活调整宽限期的设置。因此，即使合同中没有明确提及宽限期，您也可以尝试与贷款机构沟通，了解是否存在实际的宽限期。

三、特殊情况下的处理

在特殊情况下，如自然灾害、政府行为、社会异常事件等导致您无法按时还款，或者贷款机构自身系统出现故障导致您无法正常还款，您应及时与贷款机构联系，说明情况并提供相关证明。在这种情况下，即使超过还款日，也可能不被认定为逾期。

四、建议与提醒

为了避免因逾期还款而带来的不必要的麻烦和损失，我建议您：

• 仔细阅读并理解贷款合同中的相关条款，特别是关于还款期限和宽限期的规定。
• 尽量在还款日当天完成还款，以确保按时履行还款义务。
• 如果确实遇到还款困难，应提前与贷款机构沟通，寻求延长还款期限或调整还款计划的可能性。
• 保留好与贷款机构的沟通记录和相关证明，以备不时之需。

综上所述，贷款还款日第二天扣款是否算逾期，主要取决于贷款合同中的具体约定以及贷款机构的宽限期政策。因此，在实际操作中，请您务必以合同为准绳，并了解贷款机构的相关政策，以确保按时还款并维护良好的个人信用记录。