结论：员工下班吃饭被撞导致的停工损失由谁承担，需根据具体情况判断，主要涉及交通事故责任划分及工伤保险赔偿两方面。以下从不同角度详细分析：
一、交通事故责任划分角度
对方全责或主责：
- 若员工在下班吃饭途中被第三方车辆撞击，且对方负事故全部责任或主要责任，那么员工的停工损失（如医疗费、误工费等）应由对方承担。
- 员工可依据《道路交通安全法》及相关司法解释，向对方及其保险公司主张赔偿。赔偿项目通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。
员工自身责任：
- 若员工在事故中负有一定责任（如未遵守交通规则），则其停工损失可能需按责任比例自行承担一部分。
- 此时，员工仍可向对方主张部分赔偿，但赔偿金额会相应减少。
无法确定责任或双方均无责：
- 若事故责任无法确定或双方均无责任，员工可能需通过其他途径（如工伤保险）来寻求赔偿。
二、工伤保险赔偿角度
认定为工伤：
- 根据《工伤保险条例》的规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。
- 若员工下班吃饭被撞的事故符合上述条件，且已认定为工伤，则其停工期间的工资福利、医疗费用等应由工伤保险基金支付。
- 具体赔偿项目包括：医疗费、康复费、住院伙食补助费、外地就医交通费、食宿费、安装配置伤残辅助器具所需费用、生活护理费、一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性医疗补助金、一次性就业补助金（解除劳动关系时）等。
未认定为工伤：
- 若员工下班吃饭被撞的事故未被认定为工伤，则其停工损失无法通过工伤保险获得赔偿。
- 此时，员工需依据交通事故责任划分，向对方主张赔偿。
三、特殊情况处理
用人单位责任：
- 若用人单位未依法为员工缴纳工伤保险费，导致员工无法享受工伤保险待遇的，根据《工伤保险条例》第六十二条的规定，用人单位应按照工伤保险待遇项目和标准支付费用。
第三方赔偿与工伤保险赔偿的竞合：
- 若员工同时获得交通事故赔偿和工伤保险赔偿，对于医疗费等实际发生的费用，通常不能重复获赔。但对于其他赔偿项目（如伤残津贴、一次性伤残补助金等），则可能根据具体情况进行叠加或抵扣。
四、建议与行动指南
及时报警并保留证据：
- 发生事故后，员工应立即报警并保留好相关证据（如交通事故认定书、医疗记录、费用单据等），以便后续主张赔偿。
申请工伤认定：
- 若事故符合工伤认定条件，员工应在规定时间内向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
咨询专业律师：
- 由于工伤认定和赔偿涉及复杂的法律程序和规定，建议员工在处理过程中咨询专业律师（即向我咨询），以确保自身权益得到充分保障。
总结：员工下班吃饭被撞导致的停工损失由谁承担，需根据交通事故责任划分及工伤保险赔偿情况综合判断。员工应及时报警、保留证据，并在必要时申请工伤认定和咨询专业律师。