在交通事故赔偿中，若双方伤情相同，但一方在基层医院的费用高于另一方在三甲医院的费用三倍，法院的判决会综合考虑多种因素，并非单纯以费用高低作为判决依据。以下从几个关键角度进行分析：

1. 医疗费用的合理性：

   • 法院会审查双方提交的医疗费用票据、诊断证明、病历等证据，以确认医疗费用的真实性和合理性。
   • 如果基层医院的费用明显高于三甲医院，且无法提供合理解释（如特殊治疗、使用高价药品等），法院可能会认为基层医院的费用存在不合理之处，从而在判决时予以调整。

2. 伤情与治疗的对应性：

   • 法院会关注双方伤情是否一致，以及各自的治疗方案是否与伤情相符。
   • 如果双方伤情相同，但治疗方案差异显著（如一方进行了不必要的检查或治疗），法院可能会认为费用较高的一方存在过度治疗的情况，从而在判决时予以考虑。

3. 地区差异与医院等级：

   • 不同地区、不同等级的医院收费标准可能存在差异。法院在判决时会考虑这一因素，但通常不会单纯以医院等级或地区差异作为判决依据。
   • 如果基层医院的费用确实高于三甲医院，且这种差异在合理范围内（如由于地区经济水平、医院运营成本等因素导致），法院可能会认可这种差异。

4. 案例参考：

   • 在实际案例中，法院的判决往往因具体情况而异。例如，有的案例中，法院可能认为基层医院虽然费用较高，但提供了更个性化的服务或更便捷的就诊条件，因此认可了这种费用差异；而在其他案例中，法院可能认为三甲医院的治疗更专业、更规范，因此更倾向于采纳三甲医院的费用标准。
   • 具体案例：假设某起交通事故中，双方伤情均为骨折，一方在基层医院治疗花费了3万元，另一方在三甲医院治疗花费了1万元。法院在审理时，发现基层医院的治疗方案中包含了多项不必要的检查和治疗项目，而三甲医院的治疗方案则更为合理和规范。最终，法院可能判决基层医院的治疗费用中有一部分（如1万元）为不合理费用，不予赔偿，而只赔偿剩余的合理费用。

5. 法律建议：

   • 对于涉及交通事故赔偿的当事人，建议及时收集并保存好所有与医疗费用相关的证据（如票据、诊断证明、病历等），以便在诉讼中证明自己的主张。
   • 如果对医疗费用的合理性存在疑问，可以咨询专业医疗鉴定机构或律师的意见，以评估费用是否合理以及可能获得的赔偿金额。

总结来说，法院在判决交通事故赔偿案件时，会综合考虑医疗费用的合理性、伤情与治疗的对应性、地区差异与医院等级等多种因素。因此，即使双方伤情相同，但医疗费用存在显著差异时，法院也不会单纯以费用高低作为判决依据。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。