特殊建设工程未编制消防设计文件且工程已完工，这一行为确实是违法的。以下从几个角度详细分析这一问题：

1. 法律法规的明确要求：

   • 根据《中华人民共和国消防法》的相关规定，特殊建设工程在施工前，建设单位必须按照国家有关规定向消防设计审查验收主管部门申请消防设计审查，并提交消防设计文件。这是法律对特殊建设工程消防设计的明确要求，旨在确保工程在设计和施工阶段就符合消防安全标准。

2. 未编制消防设计文件的违法性：

   • 如果特殊建设工程未编制消防设计文件，就意味着该工程在设计和施工阶段没有遵循消防安全标准，这可能导致工程在完工后存在消防安全隐患。这种行为不仅违反了《中华人民共和国消防法》的规定，还可能对公共安全构成威胁。

3. 工程已完工的违法后果：

   • 即使工程已经完工，如果未编制消防设计文件或消防设计文件未经审查合格，该工程仍然不能投入使用。根据法律规定，消防设计审查验收主管部门有权对未经消防设计审查或者审查不合格的建设工程进行处罚，包括责令停止施工、停止使用或者停产停业，并处以罚款。

4. 可能的法律责任：

   • 对于建设单位而言，未编制消防设计文件或未经审查合格就擅自施工和投入使用的行为，可能面临行政处罚，如罚款、责令停产停业等。同时，如果因消防安全问题导致火灾等事故发生，建设单位还可能承担民事赔偿责任，甚至刑事责任。

5. 建议与措施：

   • 如果您是建设单位或相关责任人，发现特殊建设工程未编制消防设计文件或消防设计文件未经审查合格，应立即停止施工和投入使用，并尽快补办相关手续。同时，应加强与消防设计审查验收主管部门的沟通，确保工程符合消防安全标准后再投入使用。

总结来说，特殊建设工程未编制消防设计文件且工程已完工是违法的，这一行为不仅违反了法律法规的明确要求，还可能对公共安全构成威胁。因此，建设单位和相关责任人应严格遵守消防安全标准，确保工程在设计和施工阶段就符合相关要求。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。