结论前置：在厂区发生交通事故，报工伤后，仍然可以追究司机的责任。这两者并不冲突，分别属于不同的法律关系和救济途径。
详细分析：
工伤认定与赔偿：
- 根据《工伤保险条例》的规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。在厂区发生的交通事故，如果符合这一条件，职工有权申请工伤认定，并享受工伤保险待遇。
- 工伤赔偿主要关注的是职工因工作受伤后的医疗费用、康复费用、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金等经济补偿，其目的是保障职工的基本生活和工作能力恢复。
追究司机责任：
- 交通事故中，如果司机存在过错（如超速、酒驾、违规操作等），导致他人受伤或财产损失，司机应当承担相应的民事赔偿责任，甚至可能面临刑事责任（如交通肇事罪）。
- 追究司机责任主要关注的是事故的责任划分和赔偿问题，其目的是通过法律手段让过错方承担应有的法律后果，并赔偿受害者的损失。
两者关系：
- 工伤认定与赔偿和追究司机责任是两个独立的法律程序，它们之间并不互相排斥。职工在享受工伤保险待遇的同时，仍然有权向有过错的司机主张民事赔偿。
- 在实际操作中，职工可以先申请工伤认定并享受工伤保险待遇，然后再根据事故责任划分情况，向司机或其保险公司主张民事赔偿。如果司机存在刑事责任，职工还可以向公安机关报案，要求追究司机的刑事责任。
法律建议：
- 在处理此类事故时，建议职工及时收集并保存相关证据，如事故现场照片、医疗记录、证人证言等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。
- 职工可以先向所在单位报告事故，并申请工伤认定。同时，也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径。
- 如果司机存在过错，职工可以在律师的协助下，向司机或其保险公司提出民事赔偿要求。如果协商不成，还可以通过诉讼等法律手段来维护自己的权益。
可能后果：
- 如果职工成功申请工伤认定并享受工伤保险待遇，将能够获得一定的经济补偿，有助于其恢复工作能力和基本生活。
- 如果职工能够证明司机存在过错，并成功追究司机的民事赔偿责任，将能够获得额外的经济赔偿，进一步弥补其因事故造成的损失。
- 如果司机存在刑事责任，还将面临法律的制裁，这有助于维护社会的公平正义和交通安全秩序。
综上所述，报工伤后仍然可以追究司机的责任，两者并不冲突。职工在处理此类事故时，应充分了解自己的法律权益和可能的救济途径，并在律师的协助下积极维护自己的权益。