民事诉讼程序严重违法的判决，应当予以撤销。这是基于法律对诉讼程序公正性的严格要求，以及保障当事人合法权益的考虑。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律原则与规定
程序公正原则：
- 民事诉讼程序的设计旨在确保审判的公正性和效率性。程序违法，尤其是严重违法，会破坏这一原则，影响审判结果的公正性。
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，审判程序必须遵循法定步骤和方式，确保当事人的诉讼权利得到充分保障。
撤销判决的法律依据：
- 如果判决是在程序严重违法的情况下作出的，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关条款（如关于审判程序违法、剥夺当事人诉讼权利等情形的规定），当事人有权提出上诉或申请再审，要求撤销原判决。
- 法院在审查后，如果确认程序违法且可能影响判决结果的公正性，应当裁定撤销原判决，并可能指令原审法院重新审理或由自己提审。
二、程序违法的具体情形与后果
剥夺当事人诉讼权利：
- 例如，未依法送达诉讼文书、未给予当事人充分的陈述和辩论机会等。这些行为会剥夺当事人的诉讼权利，导致判决结果的不公正。
- 在这种情况下，判决应当被撤销，以保障当事人的合法权益。
审判组织不合法：
- 如独任审判员未经合法任命、合议庭组成不符合法定人数或资格要求等。这些情形会影响审判的公正性和权威性。
- 判决因此被撤销是维护司法公正的必要措施。
违反回避制度：
- 如果审判人员与案件有利害关系或其他应当回避的情形而未回避，会影响审判的公正性。
- 当事人有权提出回避申请，如果法院未依法处理，判决可能因此被撤销。
三、实践中的考量与建议
及时提出异议：
- 当事人在发现程序违法时，应及时向法院提出异议或上诉，以便法院及时纠正错误。
- 拖延提出异议可能导致丧失救济机会，因此及时性至关重要。
收集证据支持主张：
- 当事人应收集相关证据，如诉讼文书送达记录、庭审笔录等，以证明程序违法的存在。
- 这些证据是法院审查并决定是否撤销判决的重要依据。
寻求专业法律帮助：
- 面对复杂的诉讼程序和法律问题，当事人可以寻求专业律师的帮助。
- 律师能够提供专业的法律意见和策略，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。
总结来说，民事诉讼程序严重违法的判决应当予以撤销。这是维护司法公正、保障当事人合法权益的必要措施。当事人在发现程序违法时，应及时提出异议并收集证据支持自己的主张。如有需要，可以向我咨询相关法律问题，我会为你提供专业的法律帮助。