结论：针对邻居自建房两证不合规侵害您家权益的情况，您确实有权申请行政复议，但需满足一定条件并遵循相应程序。以下从多个角度为您详细分析：
一、行政复议的适用条件
行政行为存在：
- 行政复议是针对行政机关的具体行政行为提出的。在此情况下，若邻居的自建房行为涉及到了相关行政机关（如规划、建设、房管等部门）的审批、许可或监管，且这些行政行为存在违法或不当之处，您才有权申请行政复议。
- 例如，如果邻居在没有取得建设工程规划许可证的情况下建房，而相关行政机关未履行监管职责，您就可以针对该行政机关的不作为或违法许可行为申请行政复议。
权益受到侵害：
- 您需要证明邻居的自建房行为确实侵害了您的合法权益，如影响了您的采光、通风、通行等相邻权，或者对您的房屋安全构成了威胁。
- 证据可以包括现场照片、视频、鉴定报告、证人证言等。
二、行政复议的程序
准备材料：
- 您需要准备行政复议申请书，明确列出申请人、被申请人、复议请求、事实和理由等。
- 附上相关证据材料，如上述提到的现场照片、视频、鉴定报告等。
- 还需要提供您的身份证明和与案件相关的其他证明材料。
提交申请：
- 将准备好的行政复议申请书和相关证据材料提交给有管辖权的行政复议机关。
- 通常，行政复议机关是作出具体行政行为的行政机关的上一级主管部门或同级人民政府。
等待受理和审查：
- 行政复议机关在收到您的申请后，会进行形式审查，决定是否受理。
- 如果受理，行政复议机关会进行实质审查，包括听取双方当事人的意见、调查取证等。
作出复议决定：
- 行政复议机关在审查完毕后，会作出行政复议决定，维持、撤销或变更原具体行政行为。
- 如果您对行政复议决定不服，还可以依法向人民法院提起行政诉讼。
三、其他法律途径
协商调解：
- 在申请行政复议之前，您可以尝试与邻居进行协商调解，寻求双方都能接受的解决方案。
- 协商调解具有灵活性和高效性，可以避免不必要的法律纠纷。
民事诉讼：
- 如果邻居的自建房行为确实侵害了您的民事权益，如相邻权、财产权等，您还可以直接向人民法院提起民事诉讼。
- 民事诉讼可以要求邻居停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。
四、注意事项
及时行动：
- 如果您发现邻居的自建房行为可能侵害您的权益，应及时采取行动，收集证据并咨询专业律师。
- 拖延时间可能导致证据灭失或难以收集，增加维权难度。
理性维权：
- 在维权过程中，应保持理性态度，避免采取过激行为或言语攻击。
- 通过合法途径表达诉求，维护自身权益。
建议：针对您的情况，我建议您首先收集相关证据材料，明确邻居的自建房行为具体侵害了您的哪些权益。然后，您可以尝试与邻居进行协商调解，寻求和解。如果协商无果，您可以考虑申请行政复议或提起民事诉讼来维护自身权益。在此过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。