关于农村宅基地一户父子两个宅基地是否合法的问题，结论前置如下：
- 在符合特定条件下，一户父子拥有两个宅基地是合法的；
- 若不符合相关条件，则可能构成违法占地行为。
以下是对此问题的详细分析：
合法情形
通过合法继承取得：
- 根据我国法律规定，宅基地上的房屋属于合法财产，当房屋所有权人去世后，其继承人（不论是否为本村集体经济组织成员）有权继承该房屋。按照“地随房走”的原则，继承人可以继续使用房屋所占的宅基地。因此，如果父子一户原本就拥有一处自己申请获得的宅基地，再加上通过继承获得的房屋及宅基地，便会出现一户拥有两处宅基地的情况，这是合法的。
符合分户条件但未分户：
- 当子女成年并达到分户条件时，尽管由于种种原因未进行实际的分户操作，但如果他们已具备独立生活能力且确实需要另一处宅基地，那么在符合宅基地申请条件的前提下，经过相关部门的批准，他们可以获得新的宅基地。例如，儿子结婚后与父母共同居住带来生活不便，实际上已经分开生活，且符合当地分户条件，经过批准后，他们可以拥有两处宅基地。
宅基地总面积符合标准：
- 如果两处宅基地的总面积未超过当地规定的宅基地面积标准，这种一户两宅通常也是合法的。例如，当地规定一户宅基地面积标准是200平方米，而父子两处宅基地总面积未超标。
因管理部门衔接问题造成：
- 在过去农村宅基地管理不规范时，可能因管理部门衔接不畅导致一户两宅。只要能证明是管理部门的问题且村民无过错，这种情况也可认定为合法。
历史遗留问题或特殊政策调整：
- 由于历史原因或政策调整，某些地区可能存在一户拥有多处宅基地的合法情形。这需要根据当地的具体政策和法规来判断。例如，过去因政策宽松或管理不严导致的一户多宅，若符合当时政策且未违反现行法律，可能仍被视为合法。
不合法情形
未经批准私自建造：
- 父子未经任何合法审批程序擅自在集体土地上建造第二处住宅，违反了《土地管理法》等相关法律法规，属于违法占地建房。这种情况下，一户两宅是不合法的。
通过非法手段获取：
- 采用欺骗、贿赂等不正当手段取得第二处宅基地的审批手续，严重违反了法律规定，所取得的宅基地权益不受法律保护。这种情况下，一户两宅同样是不合法的。
不符合分户等法定条件：
- 不符合当地规定的分户条件，也不存在合法继承等法定事由，却拥有两块宅基地的情况是不被法律允许的。例如，村民未婚且无独立收入，却通过不正当手段获取了第二块宅基地，这是不合法的。
法律后果与建议
- 法律后果：如果被认定为不合法的一户两宅，相关部门可能会要求当事人限期整改，如拆除多余的宅基地房屋、退还非法占用的土地等。在严重情况下，还可能面临罚款或其他法律责任。
- 建议：在涉及宅基地问题时，建议及时咨询当地土地管理部门或向我咨询，以便了解相关法律规定并寻求合适的解决方案。同时，应确保宅基地的取得和使用符合当地政策法规和宅基地面积标准，避免不必要的法律风险。
综上所述，农村宅基地一户父子两个宅基地的合法性取决于多种因素，包括宅基地的来源、当地政策法规以及是否符合分户条件等。在处理此类问题时，应充分考虑这些因素，并确保自己的行为符合相关法律法规和政策规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。