一个儿子有两处宅基地，在特定情况下是合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. “一户一宅”原则：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地。这是宅基地分配的基本原则，即“一户一宅”。

2. 合法拥有两处宅基地的情形：

   • 如果一个儿子单独拥有两处宅基地，这通常需要通过合法的程序来获得，比如因旧宅翻建、分家析产、遗产继承等原因，并且这两处宅基地都符合当地的宅基地管理规定。
   • 例如，如果一处宅基地是祖传的，另一处是通过分家或继承获得的，且都经过了合法的登记和审批，那么这两处宅基地在法律上是可以被认可的。

3. 非法拥有两处宅基地的后果：

   • 如果儿子通过不正当手段，如违规买卖、骗取等方式获得了两处宅基地，那么这种行为是违反法律规定的。
   • 相关部门有权进行查处和纠正，村庄集体也有权且必须依据相关法律法规收回多出的那部分宅基地。

4. 特殊情况处理：

   • 在某些特定情况下，如村庄集体的重新规划与分配等，也可能导致一个儿子拥有两处宅基地。这种情况下，需要依据具体的政策规定和法律法规来判断其合法性。

综上所述，一个儿子有两处宅基地是否合法，不能简单地一概而论，而需要根据具体的情况和相关法律规定来进行判断和认定。如果你面临类似的情况或有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。